張冬杰,劉 娣,汪亮,王文濤,楊國偉
(黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,哈爾濱 150086)
葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(Glucose-6-phosphate dehydrogenase,G6PDH)與6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶(6-phosphaogluconate dehydro-genase, 6PGDH)是植物戊糖磷酸途徑中的兩個關(guān)鍵酶。G6PDH的胞質(zhì)基因與動物和真菌等真核生物具有共同的祖先;6PGDH的胞質(zhì)酶和質(zhì)體酶基因都起源于原核生物的內(nèi)共生[1]。在甜楊上的研究結(jié)果表明,低溫下G6PDH的活性會顯著的提高[2]。在人醫(yī)上主要是研究該酶在紅細(xì)胞內(nèi)活性降低和(或)酶性質(zhì)改變而導(dǎo)致的溶血性疾病。豬的PGD基因(6-phosphogluconate dehydrogenase)最初是從肝臟組織的cDNA文庫分離獲得的,并通過原位雜交的方法定位在6q2.5-2.7[3],而后的研究認(rèn)為它與肌肉的硬度也存在一定的相關(guān)性[4]。
乳酸脫氫酶(Lactate dehydrogenase,LDH)是動物體內(nèi)參與糖酵解的重要酶類,能催化丙酮酸與乳酸的相互轉(zhuǎn)變。LDH為四聚體,由M、H兩個亞基組成(分別由A和B基因編碼),共有5種同工酶形式LDH1~LDH5[5]。目前有關(guān)LDH的研究已較多,涉及到基因定位和蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)以及基因表達(dá)調(diào)控等方面[6-8]。在分子進(jìn)化方面,Holland等初步研究了LDH對溫度的適應(yīng)性[9];Glenn和Peter等通過對幾種不同的冷水魚在不同溫度下LDHA的氨基酸序列以及酶動力學(xué)研究發(fā)現(xiàn)[10-11],抗冷與不抗冷品種之間,在氨基酸序列上僅存在1~4個點(diǎn)突變,但這些點(diǎn)突變位于活性區(qū)域內(nèi),通過精細(xì)的構(gòu)象改變,改變蛋白質(zhì)的氫鍵網(wǎng)絡(luò),影響蛋白質(zhì)的靜電分布或構(gòu)象彈性,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)功能的改變。在綜合分析了PGD和LDHA基因已有的生物學(xué)功能研究報道,本研究將其作為可能影響民豬抗寒特性的候選基因進(jìn)行了研究。
75日齡民豬3窩共計12頭,將每窩個體隨機(jī)分成2組即常溫組和低溫組,每組各6頭,均購自黑龍江省農(nóng)科院畜牧研究所。2009年12月25日到2010年1月6日期間,將常溫組置于正常舍內(nèi)飼養(yǎng),溫度控制在10℃左右,低溫組在舍外半敞式大棚內(nèi)飼養(yǎng),平均溫度為-20℃,兩組均飼喂相同的飼料。處理結(jié)束后,屠宰,取大腸,腿肌、肺、脂肪、心臟、脾臟和肝臟各10 g左右,液氮帶回實(shí)驗(yàn)室,-80℃冰箱凍存。
1.2.1 RNA的提取與反轉(zhuǎn)錄
按照TRIZOL試劑的操作手冊進(jìn)行大腸,腿肌、肺、脂肪、心臟、脾臟和肝臟組織的RNA提取,獲得RNA后,進(jìn)行質(zhì)量和濃度的測定,隨后參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書進(jìn)行cDNA的合成,合成后-20℃儲存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 引物的設(shè)計與合成
根據(jù)GenBank上已公布的豬的PGD基因(X16638)、LDHA基因(AK236433)和β-actin基因(AK240355)序列設(shè)計引物,引物序列如下:PGDF: 5'GTGTTCCTGGGCAAGATAAA 3', PGDR:5'AGAAGGAGAGGGCAGTGGT 3';LDHAF:5'TGT GGCTTGGAAGATAAG 3', LDHAR: 5'GAGACAC CAGCAACATTTA 3'; actinF: 5'CGGGACCTGACC GACTACCT 3',actinR:5'GGGCCGTGATCTCCTTC T G 3'。送交上海生工合成。
1.2.3 Real-time PCR反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
反應(yīng)體系:上、下游引物各0.8 μL,Mix 10 μL,模板0.8 μL,H2O 7.6 μL,共計20 μL。反應(yīng)程序如下:95℃10 min,95℃30 s,60℃1 min,40 個循環(huán)。試驗(yàn)結(jié)果表示為 2-△△ct,其中ΔΔCt=(Ct,的基因-Ct,管家基因)試驗(yàn)組-(Ct,目的基因-Ct,管家基因)對照組。
反應(yīng)條件:95℃10 min,40個循環(huán):95℃15 s,60℃1 min,循環(huán)終止,加熔解曲線。
1.2.4 PGD和LDHA基因組織表達(dá)譜的構(gòu)建
將常溫組不同個體的大腸,腿肌、肺、脂肪、心臟、脾臟和肝臟組織的cDNA分別混合,獲得了7個cDNA池,分別以這7個cDNA池為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物使用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.2.5 PGD和LAHDA基因冷誘導(dǎo)后表達(dá)變化
將常溫組和低溫組不同個體的腿肌的cDNA分別混合,獲得2個cDNA池,分別為常溫民豬(CM)和低溫民豬(DM)組。以這2個cDNA池為模板,進(jìn)行Real-time PCR反應(yīng),每個反應(yīng)重復(fù)3次。
民豬的PGD基因在不同組織內(nèi)擴(kuò)增的PCR結(jié)果見圖1。從圖1可見,PGD基因在所檢測的7個組織內(nèi)均有表達(dá),而且表達(dá)水平均較高。
第1~7泳道:β-actin基因在大腸,腿肌、肺、脂肪、心臟、脾臟和肝臟組織的表達(dá)水平;第8泳道:DL2000 Marker;第9~15泳道:PGD基因在大腸,腿肌、肺、脂肪、心臟、脾臟和肝臟組織的表達(dá)水平Lane 1-7:The expression of β-actin gene in large intestine,leg muscle,lung,fat,heart,spleen and liver;Lane 8:DL2000 marker;Lane 9-15:The expression of PGD gene in large intestine,leg muscle,lung,fat,heart,spleen and liver
民豬的LDHA基因在不同組織內(nèi)擴(kuò)增的PCR結(jié)果見圖2。從圖2可見,基因在所檢測的7個組織內(nèi)均有表達(dá),在肺和肝臟的表達(dá)水平略高。
圖2 LDHA基因的組織表達(dá)譜Fig.2 Expression pattern of LDHA
利用Real-time PCR方法對PGD和LDHA基因在常溫民豬(CM)和低溫民豬(DM)的腿肌內(nèi)的表達(dá)變化進(jìn)行了檢測,PGD和LDHA基因的擴(kuò)增曲線和熔解曲線見圖3和圖4。檢測結(jié)果如圖5和圖6所示,采用配對樣本T檢驗(yàn)統(tǒng)計分析后發(fā)現(xiàn),PGD基因在民豬的常溫組和低溫組之間差異顯著(P<0.05)??梢姡褙i的PGD基因在低溫冷誘導(dǎo)后表達(dá)顯著增加;而LDHA基因在低溫冷誘導(dǎo)后表達(dá)顯著降低(P<0.05)。
圖3 PGD基因的擴(kuò)增曲線和溶解曲線Fig.3 Amplification plots and dissociation curve of PGD
圖4 LDHA基因的擴(kuò)增曲線和溶解曲線Fig.4 Amplification plots and dissociation curve of LDHA
圖5 低溫誘導(dǎo)后PGD基因的表達(dá)變化Fig.5 Expression of PGD gene after cold-induced
圖6 低溫誘導(dǎo)后LDHA基因的表達(dá)變化Fig.6 Expression of LDHA gene after cold-induced
PGD基因廣泛表達(dá)于哺乳動物、植物和微生物。該酶位于動物細(xì)胞的胞質(zhì)溶膠和線粒體上,位于植物的葉綠體上。它廣泛的表達(dá)于所有組織和血細(xì)胞內(nèi),是一種看家酶[12],是磷酸戊糖旁路代謝的起始酶,它提供戊糖用于核酸合成,提供還原型輔酶Ⅱ(NADPH),用于各種生物合成及維持血紅蛋白和紅細(xì)胞膜的穩(wěn)定性[13]。血細(xì)胞中缺乏PGD,臨床上通常會表現(xiàn)為溶血性貧血。本試驗(yàn)所檢測的大腸,腿肌、肺、脂肪、心臟、脾臟和肝臟組織內(nèi),該基因均高水平表達(dá),這一點(diǎn)與其他已知的看家酶特點(diǎn)相符,說明該基因在民豬上的表達(dá)并不存在組織特異性。但馬建崗在家雞上的研究顯示PGD在家雞胚胎期和未成年之前不顯示明顯的同工酶區(qū)帶[14],成年之后僅在部分組織中出現(xiàn)活性帶;任立杰等也發(fā)現(xiàn)PGD在奶牛泌乳7 d時的活性要顯著高于其他時間點(diǎn)[15],這說明PGD基因的表達(dá)在不同物種間還是存在一定差異的。在本研究中,民豬經(jīng)低溫冷誘導(dǎo)后,肌肉組織中的PGD基因的表達(dá)水平顯著升高。因?yàn)樵摶蛟谪i上以及其他哺乳動物上的相關(guān)研究報道非常少,主要都集中在對人的PGD缺乏癥的篩查、治療和機(jī)理研究上[16-17]。但是在植物上關(guān)于該基因的研究報道較多,所以我們參考了在植物上的相關(guān)研究結(jié)果。2009年林元震等報道了楊樹G6PDH基因啟動子區(qū)序列,他們發(fā)現(xiàn)該序列除了具有啟動子的基本元件TATA-box、CAAT-box外,還包含多個脅迫誘導(dǎo)元件,如低溫誘導(dǎo)元件LTR,抗凍、缺水、脫落酸、抗寒元件MYB和MYC,以及光響應(yīng)元件L-box、G-box、3AF-1、TC豐富區(qū)等[18]。而且該基因的超表達(dá),可以顯著提高煙草的抗寒凍性[19]。但由于目前豬的PGD基因序列還不全,還無法進(jìn)行更深入的研究,但從本結(jié)果來看,將其作為一個影響民豬抗寒特性的候選基因進(jìn)行研究具有一定的理論基礎(chǔ)和實(shí)際意義。
脫氫酶類是生物體內(nèi)氧化還原反應(yīng)中重要的催化劑之一,在生物體內(nèi)的氧化產(chǎn)能、解毒以及某些生理活動中起著十分重要的作用,在生產(chǎn)實(shí)踐中也有廣泛的應(yīng)用。在不同的組織中各種組分的含量和比例有所不同,它是各組織生化代謝特點(diǎn)的反映[20]。L-乳酸脫氫酶(E.C.1.1.1.27)是由基因分別位于第11號染色體上的M亞基、第12號染色體上的H亞基形成的多肽鏈所構(gòu)成的四聚體,由于各亞基在不同的組織中各種組分的含量和比例不同,形成了 LDH1(H4),LDH2(H3M1),LDH3(H2M2),LDH4(H1M3)和LDH5(M4)等5種同功酶[21]。本研究所選擇的LDHA也就是編碼M亞基的基因,因此,它也被稱作LDH-M。本研究中,LDHA基因在肺和肝臟組織的表達(dá)水平略高于所檢的其他5個組織,艾曉杰等在對白香豬的研究中發(fā)現(xiàn),肺、脾和肝臟組織中M亞基與H亞基相比略高或相同,而在腎臟和大腸中,均是H亞基占優(yōu)勢[22-24]??梢姡褙i與白香豬相比,LDHA的表達(dá)模式基本一致。
乳酸脫氫酶是一個較為公認(rèn)的與生物個體抗寒性有關(guān)的酶類,其在關(guān)鍵鉸鏈區(qū)的一個氨基酸替換就可以顯著改變生物個體的抗寒性[25]。本研究將其作為一個可能為影響民豬抗寒性的候選基因進(jìn)行了研究,結(jié)果表明,民豬在被冷誘導(dǎo)后,肌肉組織內(nèi)的LDHA基因的mRNA水平出現(xiàn)了顯著的下降。這一結(jié)果與史福勝等人在對不同海拔地區(qū)的牦牛組織中LDH的活性研究結(jié)果基本一致[26]。LDH不僅能夠催化丙酮酸和乳酸之間的相互轉(zhuǎn)化,而且還能夠調(diào)節(jié)煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)和煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADH)的比率,因而對細(xì)胞內(nèi)的一系列生化反應(yīng)起調(diào)節(jié)控制作用[27]。可見,當(dāng)民豬處于低溫環(huán)境時,它通過下調(diào)LDHA基因的轉(zhuǎn)錄來達(dá)到抵御寒冷的目的。
綜上所述,葡萄糖-6-磷酸脫氫酶在民豬的肌肉組織中受到低溫冷誘導(dǎo)后,mRNA的表達(dá)水平顯著增加,而乳酸脫氫酶A表達(dá)水平顯著下降,二者均可以考慮作為影響民豬抗寒特性的候選基因進(jìn)行研究。
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