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        一個支持芥藍起源于中國的分子證據(jù)

        2011-05-21 02:14:02王冬梅王慶彪劉玉梅楊麗梅張揚勇方智遠
        中國蔬菜 2011年16期

        王冬梅 陳 琛,2 王慶彪 莊 木* 劉玉梅 楊麗梅張揚勇 方智遠

        (1中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,北京 100081;2青島農(nóng)業(yè)大學(xué),山東 青島 266109)

        芥藍(Brassica oleracea var. alboglabra Baily),又名白花芥藍、芥蘭,是十字花科蕓薹屬一年或兩年生草本植物,2n=18,在我國廣東、廣西、福建和臺灣等地廣泛種植(Panda et al.,2003;秦耀國 等,2009;張平真,2009;周禹 等,2010)。有關(guān)甘藍類作物起源和親緣關(guān)系的信息多數(shù)來自史料記載(Helm,1963;Thompson,1976;張平真,2009):普通結(jié)球甘藍和紫甘藍大約在13世紀起源于德國;皺葉甘藍可能原產(chǎn)于意大利;抱子甘藍形成于比利時的布魯塞爾;Boswell(1949)認為球莖甘藍是15世紀在歐洲北部演化而成;花椰菜可能是在1490年由熱那亞人從黎凡特或者塞浦路斯引入意大利;青花菜由黎凡特、塞浦路斯或者克里特島引入意大利;芥藍的起源有中國南方起源說和地中海沿岸起源說兩種,尚缺乏充分的分子生物學(xué)證據(jù)。

        SSR標記由于其多態(tài)性好以及共顯性的特點(Powell et al.,1996),越來越多地應(yīng)用于基因標記、圖譜構(gòu)建、遺傳多樣性分析等方面(陳全求 等,2008)。與基因組SSR相比,EST-SSR作為功能基因的一部分,在功能基因鑒定和種間通用性上更有其優(yōu)越性(Gupta et al.,2003)。本試驗利用甘藍 EST-SSR標記,對芥藍、野生甘藍、觀賞羽衣甘藍、苤藍、皺葉甘藍、結(jié)球甘藍、紫甘藍、抱子甘藍、青花菜和花椰菜等甘藍類材料進行遺傳多樣性分析,比較芥藍與其他甘藍類作物之間的親緣關(guān)系,為芥藍起源提供分子證據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        供試材料包括甘藍類作物自交系、地方品種、一代雜種和野生甘藍等38份。其中3份野生甘藍由英國國際園藝研究中心(Warwick HRI,UK)引進,5份芥藍地方品種由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)雷建軍教授提供,花椰菜由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所花椰菜課題組提供,其余材料由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所甘藍課題組收集、提供(材料編號和名稱見表 1)。所有材料于2009、2010年定植于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所南口實驗農(nóng)場,在芥藍成熟期調(diào)查其植物學(xué)性狀,調(diào)查標準參照《芥藍種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標準》(李錫香和方智遠,2008)。苗期取幼嫩葉片,采用改良CTAB法提取DNA。

        表1 供試38份甘藍類材料名稱、類型及來源

        1.2 EST-SSR分析

        試驗所用EST-SSR引物參見陳琛等(2010)的文獻,利用8份不同甘藍變種的材料進行引物初篩,篩選出61對EST-SSR引物,并對所有38份材料進行擴增分析。PCR反應(yīng)體系為10μL,其中包括:200μmol·L-1dNTPs,上鏈和下鏈引物各2.5 pmol,0.5 U Taq酶,1×Buffer(內(nèi)含1.5mmol·L-1MgCl2),25 ng DNA模板,所用試劑均購自北京博邁德科技發(fā)展有限公司。PCR擴增反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性4min;94 ℃變性30 s,合適溫度退火30 s,72 ℃延伸1min,35個循環(huán);72 ℃延伸7min。各引物的合適退火溫度根據(jù)引物合成報告單而定。8 %聚丙烯酰胺凝膠電泳分離PCR產(chǎn)物,160 V恒壓。快速銀染法染色。

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        在相同遷移率位置上,有帶記為1,無帶記為0,缺失記為999。為保證數(shù)據(jù)準確、可靠,每塊膠板均由兩人獨立記錄,然后比對,有爭議的數(shù)據(jù)作缺失處理。應(yīng)用NTSYSpc2.11軟件采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)進行聚類分析,得到遺傳相似系數(shù),根據(jù)遺傳相似系數(shù)建立聚類圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 EST-SSR擴增分析

        本試驗利用8個具有代表性的材料對EST-SSR引物多態(tài)性進行篩選,共得到61對擴增穩(wěn)定、條帶清晰、品種間帶型差異較明顯、易于識別的引物。用這61對EST-SSR引物對38份甘藍類材料擴增,共擴增出174條多態(tài)性條帶,每對引物擴增的等位位點數(shù)不等,變幅為1~5,平均每對引物擴增2.86條帶,引物多態(tài)性總體較好。其中,引物BoE332在38份材料中的擴增結(jié)果見圖1。

        圖1 引物BoE332在部分甘藍類作物中的SSR擴增結(jié)果

        2.2 芥藍與其他甘藍類作物EST-SSR標記的聚類分析

        根據(jù)擴增結(jié)果建立數(shù)據(jù)矩陣后用NTSYSpc2.11軟件計算不同甘藍變種間的遺傳相似系數(shù),UPGMA法進行聚類分析得到38份甘藍類材料的聚類分析樹狀圖(圖2)。

        由圖2可知,在相似系數(shù)大約為0.62處,所選甘藍材料按地域分為三大類群:Ⅰ野生甘藍、觀賞羽衣甘藍、結(jié)球甘藍、紫甘藍、皺葉甘藍、苤藍和抱子甘藍。這幾類除皺葉甘藍外,其他的在史料記載中均起源于歐洲西北部沿海地區(qū)。Ⅱ青花菜和花椰菜。起源于地中海沿岸。Ⅲ芥藍。首先作為一個單獨的類群聚出,表明其與前兩大類群的甘藍類植物在進化途徑上有所不同,推測其起源于中國南方。

        在相似系數(shù)約為0.77處,13份芥藍材料可分為三類(圖2)。東升芥藍(38)是一高代自交系,聚為第一類。桃山中花(31)可葉、薹兼用,本地鐵種(32)為葉用芥藍,均表現(xiàn)為葉形橢圓、葉面平滑,聚為第二類。其余為第三類,這類材料除長葉中熟(35)葉形為橢圓外,其他材料特點是葉形寬卵圓,葉面皺縮;老種香菇(34)、長葉中熟為薹用類型,其中長葉中熟的主薹為紫紅色,側(cè)薹商品性好;日本綠(36)來自于日本,與老種香菇、長葉中熟的親緣關(guān)系較近;香港遲花(37)來自香港,與矮腳筷(33)的親緣關(guān)系較近。芥藍的植物學(xué)性狀見表2。

        圖2 基于EST-SSR分析的38份甘藍類材料聚類樹狀圖

        表2 芥藍植物學(xué)性狀調(diào)查結(jié)果

        3 討論

        本試驗將芥藍分為三類,除高代自交系東升芥藍獨為一類外,其他兩類與Okuda和Fujime(1996)根據(jù)植物學(xué)性狀的分類結(jié)果及Matsui等(2002)的RAPD分析結(jié)果基本一致,主要是根據(jù)葉形和葉面進行分類。

        芥藍的起源現(xiàn)存有兩種觀點,一是中國南方起源說,在中國目前能追溯到的最早有關(guān)芥藍的記載是宋朝蘇東坡(1037~1101)的詩句“芥蘭如菌蕈,脆美牙頰響”,距今已有 900多年的歷史;而《中國蔬菜栽培學(xué)》(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,1987)記載最早引進中國的結(jié)球甘藍和花椰菜,也只有300余年的歷史,說明芥藍可能原產(chǎn)于中國;張平真(2009)綜合了各種史學(xué)資料認為芥藍為甘藍的一個變種,并支持芥藍起源于中國南方的說法。二是地中海沿岸地區(qū)起源說,支持這一學(xué)說代表著作有《植物學(xué)》(中山大學(xué)和南京大學(xué),1984)和《中國的蔬菜》(章厚樸,1988)。本試驗中芥藍首先作為一個單獨的類群與其他甘藍類作物分開,表明芥藍與其他甘藍類作物可能是由不同路線進化而來。野生甘藍、觀賞羽衣甘藍、皺葉甘藍、結(jié)球甘藍、紫甘藍、苤藍、抱子甘藍起源于歐洲西北部沿海地區(qū);青花菜和花椰菜起源于地中海沿岸;芥藍獨立于歐洲西北部類群和地中海沿岸類群,推測其可能起源于中國。有記載早在公元前5、6世紀,一種被稱為“西土藍”的甘藍類作物傳入中國(張平真,2006),在我國副熱帶氣候條件下,逐漸選育形成芥藍;Song等(1988)的 RFLP研究中芥藍為單獨一類,與千頭羽衣甘藍親緣關(guān)系較近,被認為是一種較為原始的類型,可能起源于一種由西歐傳到東亞的原始羽衣甘藍;本試驗中芥藍作為一個單獨的類群首先聚出,與其他甘藍材料的親緣關(guān)系較遠,可能是芥藍進化形成時間較早,且進化形成的地域與其他甘藍類作物隔離,支持芥藍起源于中國的說法。本試驗中選用的野生甘藍都屬于Brassica oleracea,全部來自英國,均聚于歐洲西北部沿海類群,表明羽衣甘藍、皺葉甘藍、結(jié)球甘藍、紫甘藍、苤藍、抱子甘藍可能都起源于野生甘藍(Brassica oleracea);而至于芥藍的祖先,還需進一步收集范圍更廣的野生甘藍和近緣野生二倍體進行分析。

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