明末時期，我國發(fā)生過大規(guī)模的瘟疫。當(dāng)時，有不少庸醫(yī)照傷寒古方治療，導(dǎo)致部分患者“不死于病，乃死于醫(yī)”，疫情很難得到控制。因此，迫使諸多名醫(yī)進(jìn)行了新的探索，新的研究，共同著力遏制疫情。明朝名醫(yī)吳有性就是最為突出的一個。在抗擊疫情，他明確指出:“守古法，不合今病，以今病簡古方，原無明論，是以投劑無效也”。他系統(tǒng)地鉆研了古代醫(yī)書，發(fā)現(xiàn)歷代醫(yī)書研究溫病的太少，也有期限性。他“靜心窮理”，深入觀察，“格其所感之氣，所入之門，所受之處，及其傳變之體”，發(fā)現(xiàn)瘟疫不僅是通過空氣流行傳染，它還通過食物和接觸渠道污染，并且連環(huán)性的傳播，很快、極強(qiáng)。吳氏不斷總結(jié)臨床經(jīng)驗(yàn)，建立了不少醫(yī)案，彰明較著，反對守舊，勇于革新。同代名醫(yī)周揚(yáng)俊也有大致相同的見解，“人秉天地之氣以生，亦感天地之氣以病。夫天地之邪氣，天地之病也?！庇秩?“瘟疫之邪，從鼻口而直入于內(nèi)……”周氏以新的觀點(diǎn)，新的治法，配合同代名醫(yī)抗擊瘟疫，也作出了不可磨滅的貢獻(xiàn)。在明朝中醫(yī)文化的推動下，清朝許多名醫(yī)也熱中于研究溫病學(xué)。譬如在康熙至雍正時期，名醫(yī)葉天士不但精通內(nèi)科雜病，而且對溫病學(xué)的研究也相當(dāng)突出。從葉氏的《臨證指南醫(yī)案》和《溫?zé)嵴摗返臅?，說明了人間瘟疫，時有發(fā)生。他還觀察到“溫邪上受，首先犯肺，逆?zhèn)餍陌?，這與呼吸道傳染病引起高熱而煩躁、譫語，頗為相似。乾隆末，至道光年代，名醫(yī)吳鞠通繼續(xù)深化葉天士的醫(yī)學(xué)理論，提出溫病三焦辨證的方法，造詣很高，名不虛傳。

吳有性是個唯物主義者，他的戾(癘)氣學(xué)說，告誡人們:“病疫之由，昔以為非其時有其氣，春應(yīng)溫而反寒，夏應(yīng)熱而反涼，秋應(yīng)涼而反大熱，冬應(yīng)寒而反大溫，得非時之氣，長幼之病相似以為疫。”這個論斷，同現(xiàn)代醫(yī)學(xué)認(rèn)為病菌、病毒的繁殖、活躍與氣候的變化有著一定的相聯(lián)。吳的論點(diǎn)，恰如其分。同時他還認(rèn)為，人體腎氣旺盛，可以抵御疫癘的傳染。這與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)論及免疫功能的觀點(diǎn)似乎近似。在吳氏的病案中，可以了解到崇禎十五年，江浙地區(qū)發(fā)生過流行性感冒。這年冬天，江蘇吳縣有位大豪紳，趁著冬天氣溫變暖之日和一伙仆人外出游獵。當(dāng)他們打獵歸回后，一個個患有不同程度的周身困倦，肌肉疼痛，咽喉干澀，紅腫難咽，發(fā)熱咳嗽等。豪紳的管家見狀，即請名醫(yī)吳有性來看病。吳氏聽取各位陳述癥狀完畢，診斷為集體染上冬溫病。鑒于治法，分為三方。豪紳用第一方，三消飲加人參、鹿角膠。具體方藥:檳榔三錢，草果二錢、厚樸二錢、白芍三錢、甘草二錢、知母三錢、黃芩花三錢、大黃三錢(后下)、葛根三錢、羌活三錢、柴胡三錢、生姜三片、紅棗五枚，水煎服。發(fā)病明顯的仆人用第二方，單純應(yīng)用三消飲。發(fā)病不太嚴(yán)重的仆人，用姜蒜湯治療。因?yàn)楹兰澠剿厣钜幠I精虧損，病情較重，并有萎靡不振狀態(tài)，必須補(bǔ)腎氣，扶正祛邪，故用三消飲加人參三錢(文火另煎，將參汁兌入配方藥液同服)、鹿角膠三錢(沖化，同配方藥液混服)。第三方用生姜和生蒜頭各適量，搗爛，水煮，以沸為度，紅糖拌服。蒜頭生用或半生用，抗疫癘強(qiáng)。蘇聯(lián)衛(wèi)國戰(zhàn)爭時期，把生蒜頭當(dāng)成抗生素使用。吳氏這個驗(yàn)方，很值得后人推重。上述三方，各自服用，療效頗佳。

周揚(yáng)俊很重視氣象醫(yī)學(xué)，他對冬溫病機(jī)，曾有這么一句感言:“醫(yī)之道，難矣哉!凡病，傷寒最重，溫病尤烈。傷寒僅在一時，溫?zé)崴募窘杂?，為時既久，病者益多”。在抗擊多年的溫病，于康熙十八年間，他總結(jié)出一劑陽旦湯，方藥為桂枝三錢、芍藥酒(焙)、甘草(炙)各二錢、黃芩二錢(酒炒)、生姜三片、紅棗三枚，成為后世的驗(yàn)方。此方立了加減原則，冬溫高熱亢進(jìn)，原方加石膏一兩(先煎);咳嗽痰稠，原方加桔梗、杏仁)、瓜蔞仁各三錢;腎氣虧損，是平素體質(zhì)較差者，原方加鹿角膠三錢(烊化沖服);無汗，周身酸痛者，加薄荷三錢。以原方為中心，加減并用，乃是明清時期的通用方。治療冬溫病，確實(shí)有一定的療效。

從葉天士的著作和許多病案中，世人都知道他對呼吸道傳染病的治療水平很高。在他的病案里，述有個13歲的女孩，患的是冬溫麻疹。初起身熱無寒，頭痛，咽喉微痛，咳嗽不揚(yáng)，胸膈氣悶。先請一位醫(yī)生診視，已開疏風(fēng)清熱，降火之劑。服藥后大便三日不行，逕投生大黃二錢，服之泄瀉如水，喉痛頓瘳，頭痛益劇，身熱尤熾，肺氣仍閉，呼吸俱艱。來醫(yī)時，見肌膚色紅，麻疹稠密，周身骨節(jié)痛痹，不能轉(zhuǎn)側(cè)，肢節(jié)亦不能屈伸，甚至面目亦浮，手臂浮腫，指掌麻木，不可以握。且見脈數(shù)大，舌尖、舌邊紅絳，舌中心的后根，黃苔頗膩，為溫病象征。查閱前服處方，有牛蒡子、射干、桑葉、菊花、丹皮、板藍(lán)根、陳皮等味，以大便未行，加生大黃若干。服后大便水泄，喉痛雖除·，但稚齡真陰尚弱，逕與直瀉，陰氣先傷，陽熱浮越，遂令頭痛加甚，體熱益高，夜不成寐，癥情漸劇。故改治方法:開宜肺郁，即能透疹解肌，佐以泄熱滌痰，便是疏通胸膈，又不可寒涼直折，反致閉遏，藥貴輕清，庶合分寸。方中有瓜蔞皮錢半、白’蒺藜二錢、生紫苑二錢、郁金錢半(生打)浙茯苓錢半、酒炒黃芩錢半、浙貝母二錢、苦桔梗錢半、苦杏仁二錢、焦梔子二錢、廣陳皮一錢、路路通二錢，(去刺)、薄荷二錢(后下)，水煎服一劑，出汗后，取三劑，去薄荷，水煎服。第五日，見溫疹消退，守原方去郁金、路路通，加黨參、桑白皮各三錢，再取兩荊，水煎服，很快康復(fù)。

吳鞠通總結(jié)了前人和自己的行醫(yī)經(jīng)驗(yàn)，把冬溫病分為上、中、下三焦來辨證。上焦太陰風(fēng)溫，有咳嗽，身熱，但又不很熱，以及稍微口渴者，宜用辛涼、清熱的桑菊飲方治療:杏仁二錢、連翹一錢五分、薄荷八分(后下)、桑葉二錢五分、菊花一錢、苦桔梗二錢、甘草八分、蘆葦根二錢。放水二杯，煮取一杯，日二服。若二、三日不解，呼吸氣粗，那是燥邪在氣分，宜加石膏一兩、知母三錢。舌質(zhì)紅絳，出現(xiàn)暮熱，煩躁，說明邪入營分，宜加元參二錢，犀角(水牛角可代)一錢。邪在血分者，去薄荷、蘆葦根，加麥冬、細(xì)生地、玉竹、丹皮各二錢。咳嗽痰稠，甚至黃稠，是肺熱太甚，宜加黃芩、黃連。口渴較重者加花粉。此方的加減應(yīng)用，對治療冬天風(fēng)熱感冒，療效比較理想，代代相傳。中焦病癥和下焦病癥，多是消化系統(tǒng)、消化道疾病，例如冬溫引起腹瀉、痢疾、霍亂和溫?zé)狳S疸(流行性甲型肝炎)等。在這其中，也包括腎臟。古人認(rèn)為“腎之為臟，合水火二氣，以為五臟六腑之根”?？梢哉f，吳氏首創(chuàng)三焦辨證的方法，提出了養(yǎng)陰保液的治療原則，對冬溫，乃至溫病學(xué)的發(fā)展都作出了很大的貢獻(xiàn)。