劉建君白克鎮(zhèn)
應(yīng)用SELDI-TOF-MS技術(shù)篩查精神分裂癥血清蛋白標(biāo)志物
劉建君1白克鎮(zhèn)2
目的 應(yīng)用表面增強(qiáng)激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS)篩查精神分裂癥患者血清蛋白標(biāo)志物。方法 采集的120份血清樣本(疾病組精神分裂癥患者44例,健康對(duì)照組40名,疾病對(duì)照組抑郁癥患者36例),利用SELDI-TOF-MS及固定金屬親和表面蛋白芯片(IMAC30),檢測血清蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)。將獲得的蛋白質(zhì)譜圖進(jìn)行數(shù)據(jù)校正和分析,篩選精神分裂癥差異蛋白。建立人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型并進(jìn)行序列分析,鑒定蛋白。結(jié)果 找到15個(gè)差異峰,其中質(zhì)荷比(m/z)為1 207和1 467兩個(gè)蛋白質(zhì)峰作為輸入節(jié)點(diǎn)建立的模型,其診斷效能最高。上述兩個(gè)肽均為錳過氧化物歧化酶的N端片段,序列分別為DSGEGDFLAEGGGVR和EGDFLAEGGGVR。與抑郁癥組及健康對(duì)照組相比,精神分裂癥患者血清錳過氧化物歧化酶蛋白顯著低表達(dá)。結(jié)論 精神分裂癥患者血清存在特異性蛋白,錳過氧化物歧化酶作為潛在的特異性蛋白標(biāo)志物,值得進(jìn)行進(jìn)一步研究。
精神分裂癥 表面增強(qiáng)激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜 血清 蛋白標(biāo)志物
精神分裂癥是一種病因未明的疾病,多起病于青少年,常有感知、思維、行為等障礙和精神活動(dòng)的不協(xié)調(diào),病程多遷延。其發(fā)生率高,影響將近1%的人口。自20世紀(jì)60年代,人們對(duì)精神分裂癥的發(fā)病機(jī)理進(jìn)行了一些有意義的探討,先后建立了多巴胺系統(tǒng)(DA)亢進(jìn)學(xué)說、5-羥色胺(5-HT)學(xué)說及γ-氨基丁酸(GABA)學(xué)說,并在此基礎(chǔ)上開發(fā)出新的治療藥物,但到目前為止尚無法完全解釋精神分裂癥的病因及發(fā)病機(jī)制,尚未找出有診斷意義的生物學(xué)標(biāo)志。近幾年來隨著蛋白質(zhì)組學(xué)研究的深入,精神分裂癥的病因?qū)W研究取得了一些新發(fā)現(xiàn),本研究應(yīng)用表面增強(qiáng)激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(surface enhanced laser desorptionionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)篩選精神分裂癥患者血清蛋白標(biāo)志物,以尋找早期有效診斷精神分裂癥的客觀生物學(xué)實(shí)驗(yàn)指標(biāo)。
1.1 研究對(duì)象
病例組為2007年11月至2008年10月瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院精神科的住院患者。入組標(biāo)準(zhǔn):①符合中國精神障礙分類與診斷標(biāo)準(zhǔn)第3版(CCMD-3)的精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn),首次發(fā)病;②陽性和陰性綜合征量表(PANSS)總分≥60分;③年齡18~60歲;④入院前未服用過任何抗精神病藥物;⑤患者的法定監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①合并各種軀體疾病,如心、肝、腎、內(nèi)分泌、神經(jīng)系統(tǒng)等疾?。虎诰窕钚晕镔|(zhì)及藥物濫用。共入組44例,其中男性20例,女性24例;年齡19~48歲,平均(33± 8)歲;病程1~9個(gè)月,平均(4.5±2)個(gè)月。
疾病對(duì)照組為同期該院的抑郁癥患者,①符合CCMD-3抑郁癥診斷標(biāo)準(zhǔn),入院后未接受抗抑郁藥治療;②漢密頓抑郁量表(21項(xiàng)HAMD)總分≥20分;③年齡18~60歲;④入院前未服用過任何抗抑郁藥物;⑤患者的法定監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn)同病例組。共入組36例,其中男性17例,女性19例,年齡17~45歲,平均(32±9)歲,病程0.5~8個(gè)月,平均(3.8±1.7)個(gè)月。
健康對(duì)照組為同期到該院的健康體檢者40名,其中男性18名,女性22名,年齡21~50歲,平均(34±9)歲。
1.2 方法
1.2.1 收集標(biāo)本 清晨采集受試者空腹靜脈血2~3 mL,30 min內(nèi)置于4℃冰箱中,靜置1 h,分出血清后4℃3 000 r/min離心5 min,將分離的血清轉(zhuǎn)入Eppendof管并進(jìn)行編號(hào),再次4℃3 000 r/min離心5 min,血清分裝每管100 μL,每次分裝不少于3管,凍存于-80℃冰箱備用。
1.2.2 制備樣品 取出凍存的血清置于冰上,融解后4℃10 000 r/min離心2 min,待用。
1.2.3 上樣及洗脫 將固定金屬親和表面蛋白芯片(IMAC30-Cu美國Ciphergen公司)裝入生物芯片處理器(Bioproeessor),每孔加50 μL 0.1 mmol/L硫酸銅緩沖液,室溫振蕩10 min,棄緩沖液,迅速加入200 μL去離子水,室溫震蕩1 min。立即甩干,每孔加人200 μL 0.1mmol/L pH 4.0的醋酸鈉,室溫震蕩5 min,甩去緩沖液迅速加入200 μL去離子水,室溫震蕩1 min。甩干后每孔加人200 μL磷酸鹽緩沖液(pH=7.2),室溫震蕩5 min,重復(fù)一次。甩去磷酸鹽緩沖液迅速加入50 μL已制備好的樣品,于4℃600 r/min振蕩30 min。拍干后用200 μL結(jié)合緩沖液室溫振蕩洗滌5 min后甩去緩沖液并拍干,重復(fù)2次。甩掉緩沖液,拍干后再加入200 μL高效液相純水(HPLC H2O),快速傾去,拍干,重復(fù)洗滌1次。取出芯片,放置于室溫環(huán)境中晾干。
1.2.4 點(diǎn)加能量吸收分子 點(diǎn)加1μL芥子酸(SPA)于晾干后的芯片點(diǎn)表面,室溫放置15 min,晾干。重復(fù)點(diǎn)加1μL,晾干后即可上機(jī)測量。
1.2.5 預(yù)實(shí)驗(yàn) 采用弱陽離子芯片(CM10)、金芯片(Au)、親水芯片(NP20)、固定金屬親和表面蛋白芯片(IMAC30-Cu)4種芯片對(duì)4例精神分裂癥患者、4例正常對(duì)照的血清進(jìn)行檢測,篩選得到蛋白質(zhì)峰多、蛋白質(zhì)分離效果好、差異最明顯的芯片用于本實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,IMAC30-Cu芯片用于本實(shí)驗(yàn)效果好,兩組間蛋白質(zhì)峰差異最明顯。
1.2.6 重復(fù)性試驗(yàn) 隨機(jī)選取1例樣本,同一天內(nèi)同一芯片上重復(fù)做兩次,質(zhì)譜峰一致。同一樣品不同天不同芯片上共重復(fù)做4次,質(zhì)譜圖相同,說明實(shí)驗(yàn)批內(nèi)和批間的重現(xiàn)性都好。
1.2.7 血清蛋白質(zhì)譜檢測 采用IMAC30-Cu芯片檢測上述精神分裂癥組、疾病對(duì)照組和健康對(duì)照組的血清蛋白質(zhì)譜。利用PBSⅡ/C型蛋白質(zhì)指紋圖譜儀對(duì)結(jié)合在蛋白芯片表面的血清蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測,設(shè)定優(yōu)化范圍為1 000~20 000質(zhì)荷比(m/z),最高檢測質(zhì)荷比為100 000,激光強(qiáng)度210,檢測敏感度9。儀器采用Ciphergen公司提供的all-inone蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)分子芯片進(jìn)行校正,確定系統(tǒng)的質(zhì)量偏差≤0.1%。采用Ciphergen Proteinehip軟件自動(dòng)采集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)并備份原始檢測圖譜。對(duì)獲得的血清蛋白質(zhì)譜圖,進(jìn)行降低基線和均一化等前期處理。
1.2.8 建立診斷模型 采用基于誤差反傳原理(error back-propagation algorithm)的多層前饋(MLP)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[1],其輸入層、隱含層1、隱含層2及輸出層的節(jié)點(diǎn)分別設(shè)置為5、4、2及1。每一層運(yùn)算方式都采用正切S形傳遞函數(shù)并隨機(jī)初始化。以篩選的差異蛋白峰平均強(qiáng)度(average intensity)作為輸入節(jié)點(diǎn),精神分裂癥患者的目標(biāo)輸出值為1,疾病對(duì)照和健康對(duì)照的目標(biāo)輸出值為0,采用反向傳播(back-propagation)算法[2],建立并存儲(chǔ)人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
采用Biomarker Wizard 3.1軟件分析血清蛋白指紋圖譜,設(shè)定有意義的蛋白質(zhì)峰出現(xiàn)頻率閾值為10%,分別設(shè)定5,2兩次信噪比(S/N)過濾。三組間比較時(shí),對(duì)初步篩選的蛋白質(zhì)峰進(jìn)行F檢驗(yàn),P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 差異蛋白質(zhì)峰的檢測
利用表面增強(qiáng)激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS)(檢測120個(gè)樣品(精神分裂癥組、正常對(duì)照組和疾病對(duì)照組)血清蛋白指紋圖譜,通過Ciphergen ProteinChip 3.0軟件分析共獲得646個(gè)蛋白質(zhì)峰,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析得到差別具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的蛋白質(zhì)峰15個(gè)(P<0.01)。見表1。
2.2 建立人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型
將具有明顯表達(dá)差異的15個(gè)蛋白質(zhì)峰作為區(qū)分精神分裂癥的侯選標(biāo)志蛋白分別組合,利用訓(xùn)練集樣本,建立人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型并進(jìn)行模擬訓(xùn)練。結(jié)果顯示,以m/z為1 207和1 467的2個(gè)蛋白質(zhì)峰作為輸入節(jié)點(diǎn)建立的模型,其模擬計(jì)算的網(wǎng)絡(luò)誤差最低。以質(zhì)荷比為1 467的蛋白峰的峰強(qiáng)度為橫坐標(biāo),以質(zhì)荷比為1 207的蛋白峰的峰強(qiáng)度為縱坐標(biāo)建立點(diǎn)圖,見圖1。
表1 精神分裂癥患者與對(duì)照血清具有表達(dá)差異的15個(gè)蛋白質(zhì)峰比較 ˉx±s,mm
圖1 質(zhì)荷比為1 207和1 467的蛋白峰在三組的峰強(qiáng)度分布
通過MALDI-TOF/TOF串聯(lián)質(zhì)譜對(duì)質(zhì)荷比(m/z)為1 207和1 467兩個(gè)蛋白質(zhì)峰直接進(jìn)行了序列分析并經(jīng)Mascot數(shù)據(jù)庫搜索,確定其為錳過氧化物歧化酶MnSOD的N端片段,序列分別為DSGEGDFLAEGGGVR和EGDFLAEGGGVR。
蛋白組學(xué)是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,從整體水平研究生物體內(nèi)蛋白質(zhì)成分、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與關(guān)系,解析蛋白質(zhì)功能與生命活動(dòng)規(guī)律的新興科學(xué),蛋白組學(xué)主要依靠以下4種工具的結(jié)合進(jìn)行研究:①蛋白質(zhì)分離與純化技術(shù);②質(zhì)譜技術(shù);③蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫;④將數(shù)據(jù)庫與質(zhì)譜分析數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比的軟件。
早期的精神分裂癥蛋白質(zhì)組學(xué)研究多采用雙向凝膠電泳(two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis,2-DE)和基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOFMS)。樣品多為尸腦組織或腦脊液,如Edgor等[3]采用2-DE分析精神分裂癥患者和健康對(duì)照的海馬組織,共發(fā)現(xiàn)108種差異蛋白。Jiang等[4]采用MALDI-TOF-MS技術(shù)分析精神分裂癥患者和健康對(duì)照的腦脊液,發(fā)現(xiàn)載脂蛋白-Ⅳ(apo-lipoprotein-Ⅳ,apoA-4)顯著低表達(dá)。
表面增強(qiáng)激光解析/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS)是近幾年來興起的蛋白組學(xué)前沿技術(shù),整個(gè)系統(tǒng)包括蛋白質(zhì)芯片、飛行質(zhì)譜和軟件分析三部分。其原理是:生物粗樣品被點(diǎn)樣至蛋白質(zhì)芯片后,蛋白質(zhì)通過親和作用作用于化學(xué)位點(diǎn)或生物學(xué)位點(diǎn)。洗去雜質(zhì)蛋白和污染物,加入能量吸收分子并干燥后,在真空管中用激光轟擊,使芯片表面的待分析物電離,形成質(zhì)荷比不同的離子,根據(jù)其在電場中飛行時(shí)間的不同繪制成質(zhì)譜圖,最后通過軟件處理獲得樣品中各種蛋白質(zhì)的信息如分子量、含量等,并進(jìn)行差異分析,從而尋找有意義的蛋白質(zhì)或圖譜。其優(yōu)點(diǎn)在于①可分析經(jīng)典技術(shù)無法分析的蛋白質(zhì),包括疏水、等電點(diǎn)過高或過低的蛋白質(zhì);②獲得的圖譜單一,重復(fù)性好,可用于定量分析;③樣品無需純化,可分析復(fù)雜的生物樣品,增加了發(fā)現(xiàn)生物學(xué)標(biāo)志的機(jī)會(huì)。④樣品需要量少,檢測速度快,適合臨床診斷及大規(guī)模篩查。Huang等[5]利用SELDI-TOF-MS技術(shù)進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者甲狀腺調(diào)節(jié)蛋白和錳過氧化物歧化酶(MnSOD)兩種蛋白顯著低表達(dá),該診斷模型特異性為95%,敏感性為80%。本研究結(jié)果也顯示,與抑郁癥及健康對(duì)照相比,精神分裂癥患者血清MnSOD蛋白顯著低表達(dá)。MnSOD是體內(nèi)重要的抗氧化酶,它能清除體內(nèi)的自由基,對(duì)神經(jīng)細(xì)胞膜具有保護(hù)作用[6],它的低表達(dá)可導(dǎo)致精神分裂癥患者神經(jīng)細(xì)胞凋亡。
本研究結(jié)果表明利用SELDI-TOF-MS檢測精神分裂癥患者、抑郁癥和健康人血清蛋白指紋圖譜,通過統(tǒng)計(jì)分析以篩選精神分裂癥患者血清可能存在的特異蛋白,是可行的。研究結(jié)果表明精神分裂癥患者和健康人血清蛋白質(zhì)譜的表達(dá)具有顯著的差異性。本研究也存在一定的局限性,如未對(duì)診斷模型的敏感性和特異性進(jìn)行驗(yàn)證,樣本量偏小,樣本來源單一,未對(duì)腦脊液樣品進(jìn)行比對(duì)研究,患者病程、疾病嚴(yán)重程度、臨床分型等對(duì)蛋白標(biāo)志物是否有影響不明。這有待于大樣本多中心對(duì)照研究進(jìn)一步驗(yàn)證。
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Objective:This study aims to screen biomarkers in the serum from patients with schizophrenia using surface-enhanced laser desorption-ionization time of flight mass spectrometry(SELDITOF-MS).Methods:One hundred and twenty serum samples including 44 patients with schizophrenia,40 healthy controls and 36 patients with depressive disorder were collected.The serum protein spectra were detected using SELDI-TOF-MS and IMAC30(immobilized metal affinity capture)protein.Ciphergen ProteinChip 3.0 and Ciphergen Biomaker Wizard 3.1 software were used for data analysis and identification of different protein expression in schizophrenia,respectively.Results:Fifteen different peaks were found by Fast Classification Algorithm(QC).Two highest protein peaks with mass-to-charge-ratio(m/z)1 207 and 1 467 weremangansesuperoxidedismutasefragment,whosesequenceswereDSGEGDFLAEGGGVRand EGDFLAEGGGVR.Conclusion:Manganse superoxide dismutase is a potential specific biomarker for schizophrenia.
Schizophrenia SELDI-TOF-MS Serum Protein biomarker
2009-12-22)
(本文編輯:張紅霞)
Application of SELDI-TOF-MS technology in screening of serum proteins biomarker in patients with schizophrenia Liu Jianjun1,Bai Kezhen2.1.The Third People's Hospital of Huzhou City,Huzhou 313000;2.Affiliated Hospital of Luzhou Medical College,Luzhou 646000
國家“863計(jì)劃”支撐項(xiàng)目(2006AA02090407)
1.浙江省湖州市第三人民醫(yī)院 313000;2.四川瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院 646000。通信作者:白克鎮(zhèn),電子信箱baikezhen61@ 163.com