化學(xué)研究的最小物質(zhì)是原子,原子間強(qiáng)烈的相互作用被稱(chēng)為化學(xué)鍵,化學(xué)鍵包括共價(jià)鍵、離子鍵和金屬鍵。除化學(xué)鍵外,小分子與小分子之間、某些較大分子的基團(tuán)之間或小分子與大分子內(nèi)的基團(tuán)之間,還存在著各種各樣的作用力,總稱(chēng)分子間作用力。相對(duì)于化學(xué)鍵,分子間作用力是一種弱作用力。分子間作用力的種類(lèi)很多,其中氫鍵就是一種最常見(jiàn)的分子間作用力。
1 氫鍵的定義
氫鍵這一術(shù)語(yǔ)很容易被誤解為氫原子形成的化學(xué)鍵,其實(shí)氫鍵根本就不是化學(xué)鍵。氫鍵是已經(jīng)以共價(jià)鍵與其他原子鍵合的氫原子與另一個(gè)原子之間產(chǎn)生的分子間作用力。通常發(fā)生氫鍵作用的氫原子兩邊必須是強(qiáng)電負(fù)性原子,如F、O、N等。圖1就是9種常見(jiàn)的氫鍵形式。
2 氫鍵的成因
在氫鍵X-H…Y模型中,X和Y通常是電負(fù)性很強(qiáng)、半徑很小的原子。由于X的電負(fù)性很強(qiáng),將使X--H的鍵合電子對(duì)強(qiáng)烈偏向X原子,氫原子核就相對(duì)地從鍵合電子云中“裸露”出來(lái),成為一帶正電荷的“裸露”原子核,同時(shí)Y原子的電負(fù)性越強(qiáng)、半徑越小,其孤對(duì)電子的負(fù)電場(chǎng)就越集中而強(qiáng)烈,帶正電荷的“裸露”氫原子核就越有余力吸引Y原子的孤對(duì)電子而形成氫鍵。除氫原子外的其他一切原子,由于核外包裹著電子,原子核不能“裸露”出來(lái),而不能形成氫鍵。因此,氫鍵形成的基本條件有二:一是氫原子;二是氫原子兩側(cè)具電負(fù)性很強(qiáng)的其他原子。
3 氫鍵的分布
根據(jù)氫鍵形成的基本條件可知,氫鍵既可存在于小分子之間,如水分子與水分子之間;也可存在于小分子與大分子之間,如細(xì)胞中的水分子可通過(guò)氫鍵與蛋白質(zhì)、淀粉等大分子結(jié)合在一起形成結(jié)合水;又可存在于大分子內(nèi)部,如蛋白質(zhì)、核酸等大分子的不同基團(tuán)之間存在著大量的氫鍵。
4 氫鍵對(duì)于生命的意義
4.1 氫鍵影響水的物理性質(zhì)
水是生物體內(nèi)含量最多的化合物。由于水分子之間氫鍵的作用,導(dǎo)致冰的密度小于液態(tài)水、4℃時(shí)水的密度最大;與同周期的其他氫化物(如HS、H2Se、H2Te)相比,水具有較高的熔沸點(diǎn)、比熱和汽化熱等。水的這些特異物理性質(zhì)對(duì)于生命的存在有著決定性的意義。較高的熔沸點(diǎn)使得地表溫度下水以液態(tài)形式存在,于是才有生命的發(fā)生;如若冰的密度比液態(tài)水的密度大、液態(tài)水從0℃上升至4℃密度不增大,地球上所有水體在冬天結(jié)冰時(shí),所有水生生物都會(huì)被凍死;高的比熱和汽化熱使水成為生物體內(nèi)良好的溫度調(diào)節(jié)劑:水的高比熱可使機(jī)體易于維持恒定的體溫,使體內(nèi)的生化反應(yīng)得以正常進(jìn)行,同時(shí)也使機(jī)體能更好地適應(yīng)環(huán)境溫度的變化;高汽化熱使水成為有機(jī)體的冷卻劑,如植物葉片的蒸騰作用及動(dòng)物的排汗,均可降低機(jī)體的體溫,維持體溫的相對(duì)恒定。
4.2 氫鍵影響蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)
蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的體現(xiàn)者,其通常有一條或多條肽鏈組成,組成蛋白質(zhì)的多肽鏈并不是一條松散的肽鏈。研究表明,一條多肽鏈上每個(gè)氨基酸殘基的N-H與前面隔三個(gè)氨基酸殘基的C=0均可形成氫鍵,正是這些鏈內(nèi)氫鍵的存在使多肽不再是直線狀,而是發(fā)生盤(pán)繞形成僅螺旋(圖2)。當(dāng)二條或多條肽鏈幾乎完全伸展的側(cè)向聚集在一起時(shí),相鄰肽鏈上N-H和C=0之間可形成有規(guī)則的氫鍵,也正是這些鏈間氫鍵的存在使多肽發(fā)生空間上的折疊,導(dǎo)致不同肽鏈按層排列,形成所謂的B折疊(圖3)。在β折疊中,所有肽鏈都參與鏈間氫鍵的交聯(lián),氫鍵與肽鏈的長(zhǎng)軸接近垂直。α螺旋與β折疊在形成蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)中具有重要作用。
4.3 氫鍵影響DNA的三維結(jié)構(gòu)
DNA是絕大多數(shù)生物的遺傳物質(zhì),是生命活動(dòng)的控制者。科學(xué)家沃森和克里克指出,DNA是有規(guī)則的雙螺旋結(jié)構(gòu)。DNA的兩條脫氧核苷酸長(zhǎng)鏈反向平行排列在雙螺旋結(jié)構(gòu)的外側(cè),構(gòu)成DNA的基本骨架,內(nèi)側(cè)通過(guò)脫氧核苷酸之間的堿基互補(bǔ)配對(duì)連接起來(lái),其中A一定與T配對(duì),G一定與C配對(duì),配對(duì)的堿基通過(guò)氫鍵相互交聯(lián),在每一個(gè)堿基上都有適于形成氫鍵的供氫體(如氨基和羥基)和受氫體(如酮基和亞氨基),其中G-C之間形成三個(gè)氫鍵,A-T之間形成二個(gè)氫鍵。正是由于這些氫鍵的主導(dǎo)作用,才形成了DNA分子獨(dú)特的雙螺旋三維結(jié)構(gòu)。