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        軟弱的超級(jí)計(jì)算機(jī)

        2009-12-31 00:00:00
        新知客 2009年8期

        現(xiàn)在的超級(jí)計(jì)算機(jī)通常都有幾千顆CPU,速度已經(jīng)超過(guò)每秒千萬(wàn)億次,但能支持500顆以上CPU的應(yīng)用軟件卻很少。像國(guó)家天文臺(tái)需要上千個(gè)CPU的運(yùn)算卻缺少軟件可用。

        上海超級(jí)計(jì)算中心總共有300多個(gè)用戶,醫(yī)生丁海是其中一個(gè)。他獨(dú)立研究的課題涉及較復(fù)雜的模擬計(jì)算,用普通的電腦根本跑不起來(lái),于是他到超算中心,申請(qǐng)使用一部分計(jì)算資源。

        128顆CPU的極限

        到超算中心排隊(duì)的單位一直很多。截至2008年,中心裝備的曙光4000A型超級(jí)計(jì)算機(jī)CPU使用率已達(dá)到88.5%。這臺(tái)擁有2048顆CPU的超級(jí)計(jì)算機(jī)已經(jīng)接近“滿負(fù)荷運(yùn)轉(zhuǎn)”。2009年6月,“魔方”的加盟將中心可提供的計(jì)算能力一下字提升了20倍。它是曾在2008年底排名世界前十的計(jì)算機(jī),峰值運(yùn)算速度達(dá)到每秒230萬(wàn)億次。然而沒(méi)能進(jìn)入隊(duì)列的任務(wù)還是很多。

        丁海只需要用幾十顆CPU,但在300多個(gè)用戶中已經(jīng)略高于平均數(shù)——雖然中心的客戶中不乏蛋白質(zhì)折疊這樣的大型科學(xué)計(jì)算和國(guó)產(chǎn)大飛機(jī)設(shè)計(jì)這樣的大型工程項(xiàng)目,但大型用戶并不占大多數(shù)。據(jù)上海超算中心2008年12月的簡(jiǎn)報(bào)統(tǒng)計(jì),在當(dāng)月新增的10個(gè)用戶里,只有清華大學(xué)航空航天學(xué)院、南京大學(xué)物理系和上海天文臺(tái)三家占用的CPU資源在128顆以上。

        “不可能給得太多”,中心副主任袁俊說(shuō)。中心為了照顧到300多個(gè)用戶的需要,必須進(jìn)行協(xié)調(diào)管理,才能最大發(fā)揮其整體效能。成立于2000年的上海超算中心不僅承擔(dān)著“國(guó)家網(wǎng)格”計(jì)劃的南方主節(jié)點(diǎn)任務(wù),還為華東地區(qū)乃至全國(guó)的科研單位和工程用戶提供開(kāi)放的計(jì)算服務(wù)。袁俊告訴記者,128顆,往往是上海超算中心為單個(gè)任務(wù)所能提供CPU數(shù)的最大值。

        事實(shí)上,即使資源方面沒(méi)有限制,很多大型項(xiàng)目也因?yàn)榧夹g(shù)上的原因用不上那么多運(yùn)算資源。

        規(guī)模再大軟件控制不了

        南京航空航天大學(xué)的飛行器設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)室曾經(jīng)從浪潮公司購(gòu)置過(guò)一套十多個(gè)節(jié)點(diǎn)的高性能計(jì)算集群,可用著用著就發(fā)現(xiàn)不夠用了。他們計(jì)劃購(gòu)買一套更大的,升級(jí)到64個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)。購(gòu)買,安裝,遷移任務(wù),一切停當(dāng),一個(gè)奇怪的現(xiàn)象出現(xiàn)了:運(yùn)算效率不僅并沒(méi)有提升,反而下降了。研究人員只好請(qǐng)來(lái)浪潮的維護(hù)工程師,發(fā)現(xiàn)問(wèn)題出在該應(yīng)用軟件的擴(kuò)展性上——原來(lái)的軟件根本不能支持這么多CPU。

        據(jù)浪潮公司提供的一份資料顯示,雖然數(shù)百上千個(gè)CPU級(jí)別的計(jì)算機(jī)集群現(xiàn)在已經(jīng)大量出現(xiàn),但支持500個(gè)CPU以上的應(yīng)用軟件卻很少。許多流行的高性能軟件,特別是廣泛應(yīng)用的開(kāi)源軟件,如在地震預(yù)報(bào)、蛋白質(zhì)計(jì)算中運(yùn)用的軟件,并行度并不高,有的甚至還是串行程序。這就好比是好不容易修好了一條高速公路,回頭一看,卻缺乏好車。

        “現(xiàn)在的關(guān)鍵是軟件跟不上硬件的發(fā)展速度,導(dǎo)致超級(jí)計(jì)算機(jī)的計(jì)算能力發(fā)揮不出來(lái)?!崩顺惫痉?wù)器部門的經(jīng)理包艷婷說(shuō)。對(duì)此中國(guó)科學(xué)院超級(jí)計(jì)算中心主任遲學(xué)斌認(rèn)為,在研發(fā)的歷史上,我們一直重視有形的東西,忽視無(wú)形的東西。計(jì)算機(jī)固然很重要,但是如果在這個(gè)平臺(tái)上沒(méi)有要做的事,那也等于是浪費(fèi)。

        對(duì)上海超算中心來(lái)說(shuō),困難主要是價(jià)格問(wèn)題。盡管上海市政府給了他們令同行羨慕的的持續(xù)經(jīng)費(fèi)支持,使他們可以采購(gòu)中國(guó)最好的計(jì)算機(jī)硬件,卻無(wú)法將最好的軟件也統(tǒng)統(tǒng)搬來(lái)。國(guó)家天文臺(tái)可能是中心的用戶里對(duì)CPU要求最高的之一,他們需要上千個(gè)CPU同時(shí)工作,以計(jì)算海量的天文觀測(cè)數(shù)據(jù)。但能支持的軟件在國(guó)際上也很少,即使有也買不起,他們只好自己編寫開(kāi)源代碼。它更自由,卻未必好用。

        再者,能夠?qū)懘祟愜浖娜瞬盘^(guò)稀少。國(guó)內(nèi)高等教育研究生以上學(xué)歷的教育中,完備、深度的“計(jì)算科學(xué)”教育既不系統(tǒng),也不完整,更沒(méi)有基于并行計(jì)算方面的計(jì)算科學(xué)教育和訓(xùn)練。同時(shí),計(jì)算科學(xué)和各應(yīng)用科學(xué)的團(tuán)隊(duì)在互相協(xié)作方面也缺乏機(jī)制。美國(guó)一個(gè)成熟的計(jì)算應(yīng)用軟件通常都經(jīng)歷了至少20年以上的持續(xù)開(kāi)發(fā),如計(jì)算化學(xué)軟件NWCHEM,開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)里化學(xué)家、計(jì)算數(shù)學(xué)家、計(jì)算機(jī)科學(xué)家保持了合適的比例,政府也給予了資金支持。

        跨越“軟”“硬”鴻溝

        “魔方”的誕生將中國(guó)的超級(jí)計(jì)算一下子帶入了百萬(wàn)億次計(jì)算時(shí)代,但是應(yīng)用卻仍停留在幾萬(wàn)億次到幾十萬(wàn)億次的水平,中間至少相差了一代。

        曙光公司總裁歷軍認(rèn)為,“機(jī)器和應(yīng)用之間有一代的差距是可以理解的。上一代的曙光4000A剛出來(lái)時(shí)也面臨有沒(méi)有人用的問(wèn)題,但到今天我們國(guó)家的大飛機(jī)設(shè)計(jì)、神舟飛船、基因研究、石油勘探上面都用上了,可見(jiàn)機(jī)器帶動(dòng)應(yīng)用是現(xiàn)階段的必經(jīng)之路?!笨磥?lái),超級(jí)計(jì)算機(jī)超前于應(yīng)用的發(fā)展似乎不完全是壞事,只有有了更加強(qiáng)大的計(jì)算機(jī),應(yīng)用軟件和算法研究人員也才可能發(fā)現(xiàn)原有軟件和算法的問(wèn)題。

        大規(guī)模并行軟件的開(kāi)發(fā)是個(gè)累活,周期很長(zhǎng),不像硬件升級(jí)那樣見(jiàn)效快。在過(guò)去,軟件都是串行編寫,假定在一個(gè)CPU上面執(zhí)行任務(wù)。超級(jí)計(jì)算機(jī)把這種情況徹底打破了,轉(zhuǎn)而強(qiáng)調(diào)“并行計(jì)算”。高性能計(jì)算的原理其實(shí)并不復(fù)雜,就是將一個(gè)任務(wù)分成幾份,每個(gè)服務(wù)器完成一份,但并行化的基礎(chǔ)是對(duì)此代碼涉及的應(yīng)用科學(xué)有透徹的了解,在理解的基礎(chǔ)上,再進(jìn)行合理的任務(wù)切分,精細(xì)地處理負(fù)載平衡、通信等問(wèn)題。因此才出現(xiàn)了能夠?qū)懖⑿熊浖母呒?jí)人才少之又少的局面。

        事實(shí)上,為超級(jí)計(jì)算機(jī)編程更是數(shù)學(xué)家的工作。他們不僅要有精湛的數(shù)學(xué)頭腦,懂得各種編程語(yǔ)言,還要熟悉計(jì)算機(jī)硬件。更重要的是,他們必須愿意投入時(shí)間來(lái)設(shè)計(jì)各種算法和進(jìn)行軟件編程,最后,還要確保軟件經(jīng)過(guò)調(diào)試能夠在超級(jí)計(jì)算機(jī)上使用。名噪一時(shí)的“深藍(lán)之父”許峰雄就是這樣一個(gè)人。這個(gè)對(duì)于人機(jī)對(duì)弈有著狂熱興趣的天才,更像是一名有著發(fā) 達(dá)數(shù)學(xué)頭腦的軟件程序員。還在念大學(xué)時(shí),他幾乎每天吃飯路上腦子里都在琢磨如何在計(jì)算機(jī)上實(shí)現(xiàn)更快的出棋步數(shù)。為了戰(zhàn)勝卡斯帕羅夫,許峰雄和他的同事前后用了十多年。

        2009年6月,國(guó)內(nèi)服務(wù)器行業(yè)的領(lǐng)軍企業(yè)浪潮集團(tuán)和中國(guó)超級(jí)計(jì)算領(lǐng)域的“專家團(tuán)”——中科院超算中心簽署了一項(xiàng)戰(zhàn)略合作協(xié)議,試圖聯(lián)手攻克“軟硬失衡”這一困擾超級(jí)計(jì)算機(jī)多年的難題。浪潮有豐富的市場(chǎng)經(jīng)驗(yàn),能準(zhǔn)確把握用戶的需求,可以安排大量的經(jīng)驗(yàn)豐富的一線軟件工程師和系統(tǒng)維護(hù)人員,而中科院超算中心則在體系架構(gòu)、硬件設(shè)計(jì)上提供理論上的支持。這是一項(xiàng)艱巨的系統(tǒng)工程,其成效果尚需時(shí)日。

        下一代千萬(wàn)億次計(jì)算機(jī)已經(jīng)在研制了。這臺(tái)名為曙光6000A的超級(jí)計(jì)算機(jī)已經(jīng)被深圳市預(yù)訂,但如果軟件水平不能迅速跟上,“軟硬失衡”的“魔咒”將給它帶來(lái)更大的麻煩——那可是千萬(wàn)億次。

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