摘要:分泌蛋白對于細(xì)菌自身的生命活動以及在介導(dǎo)病原體與宿主之間相互作用的過程中發(fā)揮著重要的作用,深入研究分泌蛋白將有助于明確細(xì)菌的生命活動及與病原微生物互作的分子機(jī)制,利用多殺性巴氏桿菌(Pasturella multocida)基因組學(xué)研究成果,結(jié)合信號肽分析軟件signalP v3.0、跨膜螺旋結(jié)構(gòu)軟件TMHMM v2.0、亞細(xì)胞器蛋白定位軟件PSORTh和GPI—錨定位點(diǎn)軟件GPI—SOM這4個軟件,對多殺性巴氏桿菌2105個編碼蛋白的ORF進(jìn)行預(yù)測分析,最終獲得了136個分泌蛋白。對其信號肽長度、氨基酸組成、相應(yīng)ORF長度進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)。運(yùn)用Blast P對其功能進(jìn)行同源性分析,發(fā)現(xiàn)11個蛋白為多殺性巴氏桿菌所特有,這對多殺性巴氏桿菌的臨床診斷具有一定的潛在應(yīng)用價(jià)值。
關(guān)鍵詞:多殺性巴氏桿菌;分泌蛋白;信號肽;生物信息學(xué)
中圖分類號:S852.61+2;Q78
文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A
文章編號:0439—8114(2009)11—2642—04