薛金艷 王清路 竇 燁 李俏俏
摘要禽流感(AI)是由A型禽流感病毒(AIV)引起的禽類烈性傳染病。它不僅給世界養(yǎng)禽業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,而且對(duì)人類健康和生命安全構(gòu)成了嚴(yán)重威脅。因此,禽流感已經(jīng)成為人們關(guān)注的焦點(diǎn)。從病原基因組及其編碼的蛋白質(zhì)、致病力、變異性以及對(duì)AIV的分子診斷等角度就AIV的分子生物學(xué)研究進(jìn)行綜述,為防治AI提供理論基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞禽流感病毒;基因組;變異性;分子診斷;研究進(jìn)展
中圖分類號(hào) R51 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼A文章編號(hào) 1007-5739(2009)11-0216-02
禽流感(Avian influenza,AI)是由正粘病毒科A型流感病毒引起的全身性或呼吸器官性傳染病,國(guó)際獸疫局(OIE)把該病定為A類烈性傳染病。禽流感病毒(Avian influenza vi- rus,AIV)典型的病毒粒子為球形,直徑80~120nm,有時(shí)呈絲狀體等多形態(tài),至今A型流感病毒的血凝素已發(fā)現(xiàn)有16種,神經(jīng)氨酸酶有10種。其血清型較多,容易變異。常發(fā)生在禽,有時(shí)也發(fā)生在低等哺乳類動(dòng)物,至今在人僅有偶發(fā)病例。禽流感病毒根據(jù)其對(duì)雞致病性的不同分為高致病性、中致病性和低/非致病性。禽流感病毒不僅會(huì)給養(yǎng)禽、畜牧業(yè)帶來(lái)災(zāi)難性的破壞,而且對(duì)公共健康也構(gòu)成了嚴(yán)重威脅。
1AIV基因組及其編碼蛋白的功能
1.1AIV基因組
AIV基因組為單股負(fù)鏈RNA,共有8個(gè)獨(dú)立的RNA節(jié)段。通過(guò)對(duì)某些毒株8個(gè)節(jié)段的測(cè)序,發(fā)現(xiàn)它們存在一些共同的特點(diǎn),即所有基因節(jié)段的5′端前13個(gè)核苷酸均相同,3′端也有12個(gè)高度保守的核苷酸,另外在每一節(jié)段靠近5′端15~21位核苷酸處有一保守區(qū)。其序列為PolyU。這一序列可以在病毒mRNA合成時(shí)產(chǎn)生PolyA。
1.2病毒的蛋白
1.2.1血凝素(Hem agglutinin,HA)。HA是流感病毒囊膜纖突的主要成分之一,是基因表達(dá)產(chǎn)物中最大的糖蛋白,為誘生保護(hù)性免疫的主要抗原,HA在病毒吸附及穿膜過(guò)程中起關(guān)鍵作用,刺激機(jī)體產(chǎn)生的中和抗體,可中和病毒的感染力,抵抗病毒的感染和發(fā)病。它是A型流感病毒毒力的主要決定因素。
1.2.2神經(jīng)氨酸酶(Heuram in idase,NA)。NA由病毒核糖核酸(vRNA)片段6編碼,是另一個(gè)主要的表面抗原,其成熟的形式是具有催化活性的四聚體,能將唾液酸從糖蛋白和糖脂中切開(kāi)。其作用是水解細(xì)胞表面的特異性糖蛋白末端的N—乙?;窠?jīng)氨酸。避免病毒粒子的聚集,有利于病毒的釋放,對(duì)病毒在感染細(xì)胞周圍的擴(kuò)散能力有很大影響。
1.2.3核蛋白(Nucleo protein,NP)。NP是由片段5編碼的結(jié)構(gòu)蛋白。主要功能是使病毒RNA(vRNA)形成核糖核蛋白復(fù)合體,以此來(lái)穩(wěn)定vRNA,使其免受核糖核酸作用。另外,NP在病毒基因組的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制以及決定病毒的宿主特異性方面都有重要的作用,而且它是細(xì)胞毒性淋巴細(xì)胞識(shí)別的主要抗原。
1.2.4基質(zhì)蛋白(Matrix protein,MP)。第7節(jié)段RNA編碼的蛋白被稱為M1,部分分子量較小的蛋白稱為M2。M1構(gòu)成病毒的基質(zhì)膜,具有型特異性,其抗原性的差異也是流感病毒分型的依據(jù)之一。另外,M1在子代病毒粒子的裝配方面也有一定的作用。M2是一種跨膜蛋白,其作用是在HA合成過(guò)程中作為離子通道控制高爾基體內(nèi)的pH值,在病毒脫殼時(shí)酸化病毒粒子的內(nèi)部環(huán)境。
1.2.5聚合酶蛋白(PB1、PB2、PA)。A型流感病毒的聚合酶蛋白由PB1、PB2、PA等3種成分組成。這3種蛋白質(zhì)的共同特點(diǎn)是含有一特異的親核序列區(qū),其作用是使這幾種蛋白質(zhì)在胞漿合成后能順利進(jìn)入細(xì)胞核。其中,PB2、PB1與合成互補(bǔ)RNA有關(guān),而PA、核蛋白與病毒的RNA合成有關(guān)。
1.2.6非結(jié)構(gòu)蛋白(Non-structural proteins,NS)。A型流感病毒的結(jié)構(gòu)蛋白由片段8編碼。片段8也有2個(gè)編碼框,可編碼2種蛋白質(zhì)即NS1和NS2。NS1和NS2 兩種非結(jié)構(gòu)蛋白的編碼區(qū)是基因組中最小的RNA片段。NS1和NS2相互間有70個(gè)氮基酸重疊,分別由不同的mRNA翻譯,提示它們由不同讀碼框架翻譯。在早期感染中NS1合成并在細(xì)胞核內(nèi)積聚,磷酸化的NS1蛋白在病毒的復(fù)制過(guò)程中起調(diào)節(jié)作用;NS2主要在晚期感染中出現(xiàn),并主要在胞漿中存在,目前它的功能還沒(méi)有徹底搞清。
1.2.7其他蛋白質(zhì)(HE、M3、NB)。由基因節(jié)段7編碼,明確的功能還不清楚。
1.3AIV毒力變異的分子基礎(chǔ)
AIV很容易發(fā)生變異,誘發(fā)AIV發(fā)生變異的主要機(jī)理有抗原性變異,即抗原漂移(Antigenic Drift)和抗原轉(zhuǎn)變(Antigenic Shift)。在甲型流感病毒中,抗原漂移主要是由HA或NA基因發(fā)生點(diǎn)突變引起的,其中HA基因的變異率最高。每個(gè)核苷酸在每個(gè)復(fù)制周期中的變異率可高達(dá)2.0%。一般認(rèn)為,來(lái)自宿主的免疫壓力是HA和NA抗原漂移的主要原因。由于突變幅度較大或各節(jié)段RNA間發(fā)生的重排導(dǎo)致抗原性發(fā)生大轉(zhuǎn)變導(dǎo)致新病毒亞型的產(chǎn)生,這種變異稱為抗原轉(zhuǎn)變。大量試驗(yàn)證明,不同亞型病毒同時(shí)感染1個(gè)細(xì)胞時(shí),病毒基因組可發(fā)生節(jié)段間的交換。理論上講,8個(gè)RNA片段存在256個(gè)不同的組合方式。事實(shí)證明,在自然界中經(jīng)常有混合感染導(dǎo)致基因重組的事件發(fā)生。
2AIV的分子診斷
2.1血清學(xué)診斷技術(shù)
血清學(xué)診斷技術(shù)是從禽類體內(nèi)采集血液析出血清后,檢測(cè)血清中抗體的有無(wú)和滴度變化,如瓊脂凝膠擴(kuò)散試驗(yàn)(AGID)、細(xì)胞凝集抑制試驗(yàn)(HI)。AGP試驗(yàn)鑒定病毒或檢測(cè)特異性的血清抗體或基質(zhì)蛋白MP(Matrix protein)、特異性核蛋白NP。血細(xì)胞凝集試驗(yàn)(HA)和血細(xì)胞凝集抑制試驗(yàn)(HIT)鑒定病毒或血清抗體的亞型,神經(jīng)氨酸酶抑制試驗(yàn)(NI)鑒定病毒或血清抗體亞型等。
2.2RT-PCR分子診斷技術(shù)
崔尚金等(1998)建立了一種能夠直接檢測(cè)禽糞和雞胚尿囊液中H亞型禽流感病毒RNA的RT-PCR檢測(cè)方法。檢測(cè)過(guò)程僅需8h,不僅具有高度的敏感性和特異性,還可大大縮短對(duì)禽流感病毒的檢出時(shí)間。而應(yīng)用毛細(xì)管PCR(15 min,30個(gè)循環(huán))代替常規(guī)PCR(2.5h,30個(gè)循環(huán))進(jìn)一步縮短檢測(cè)時(shí)間的研究也已展開(kāi)。并進(jìn)入更深層次的領(lǐng)域,以期用于不同樣品的檢測(cè),使該方法更加適用于禽流感病毒的臨床早期診斷。該技術(shù)在特異地檢出H或H亞型禽流感病毒同時(shí),還可根據(jù)應(yīng)用特定引物經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增出的H和H包括裂解位點(diǎn)在內(nèi)的HA基因片段。經(jīng)測(cè)序推導(dǎo)出的氨基酸序列,判斷H或H亞型禽流感病毒的致病性高低。
2.3酶免疫測(cè)定(EIA)技術(shù)
EIA技術(shù)在AI的診斷與監(jiān)測(cè)方面已被廣泛采用。Doller等建立了一種從鼻咽分泌物中直接檢測(cè)流感病毒抗原的酶免疫方法,該方法無(wú)須對(duì)病料進(jìn)行超聲處理,而且在4h即可出結(jié)果。Cherian等建立了一種用于檢測(cè)呼吸道分泌物中A型流感病毒RNA的PCR酶免疫(PCREIA)方法。該方法對(duì)感染后4d的病料A型AIV的檢測(cè)特別有效。Schweiger等建立了用于檢測(cè)A型AIVN1和N2型的DNA酶免疫(DEIA)方法。該方法簡(jiǎn)單、快速,可進(jìn)行大批樣品的檢測(cè)。
2.4熒光PCR法
熒光RT-PCR技術(shù)是20世紀(jì)90年代末發(fā)展起來(lái)的新技術(shù),將熒光素標(biāo)記的探針與引物一起,在熒光PCR儀中反應(yīng),電腦對(duì)整個(gè)反應(yīng)進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),避免了交叉污染,提高了檢測(cè)敏感性,已成功用于人乙型肝炎病毒、衣原體、艾滋病病毒等的檢測(cè),根據(jù)A型禽流感病毒的共有NP基因序列設(shè)計(jì)引物、探針,建立的通用型熒光RT-PCR檢測(cè)方法不僅能夠用來(lái)檢測(cè)禽流感病毒H5、H7、H9亞型,而且對(duì)其他禽流感病毒亞型也能檢出。用通用型探針、引物檢測(cè)常見(jiàn)其他禽類病毒,未發(fā)現(xiàn)交叉反應(yīng)。說(shuō)明該方法敏感性高、特異性強(qiáng)。
2.5核酸探針技術(shù)
核酸分子雜交技術(shù)是目前生物化學(xué)和分子生物學(xué)研究應(yīng)用最廣泛的技術(shù)之一,是定性和定量檢測(cè)特異性DNA或RNA的有力工具。用PCR技術(shù)制備了核蛋白基因片段(NPC)的地高辛標(biāo)記cDNA探針,建立并優(yōu)化了檢測(cè)AIV的探針雜交法。該探針具有較好的特異性和敏感性,為從分子水平探討禽流感的發(fā)病機(jī)理和臨床早期快速診斷提供了新的研究手段。對(duì)以基因芯片技術(shù)為基礎(chǔ)的檢測(cè)H5、H7、H9亞型禽流感病毒的診斷技術(shù)進(jìn)行了研究,結(jié)果表明,DNA芯片技術(shù)可以提供一種有效的AIV診斷方法。
3結(jié)論
禽流感是一種全球性的烈性傳染病,可在宿主中不斷發(fā)生變異和基因重組,是2l世紀(jì)我國(guó)養(yǎng)禽業(yè)將面臨的最大的瘟疫性威脅。禽流感可在禽、豬和人中進(jìn)行傳播。AIV不僅作為人流感的最大基因庫(kù)而間接威脅人類健康,而且還可作為人類的新病毒而直接構(gòu)成人類的威脅。因此,預(yù)防禽流感具有重要的公共衛(wèi)生意義和經(jīng)濟(jì)意義。隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)、微生物學(xué)、免疫學(xué)等學(xué)科的發(fā)展,以及同其他學(xué)科間的滲透,禽流感的傳統(tǒng)檢測(cè)診斷技術(shù)將與現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)結(jié)合或者現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)與其他學(xué)科研究技術(shù)有機(jī)結(jié)合,一定會(huì)實(shí)現(xiàn)診斷的快捷、方便、準(zhǔn)確、靈敏、經(jīng)濟(jì)、易操作,為禽流感的防治做出重大貢獻(xiàn)。
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