摘要:以PCR擴(kuò)增新城疫病毒JZ05株的F基因,井進(jìn)行克隆和測(cè)序。采用DNAssist序列分析軟件將JZ05毒株F基因與另外18個(gè)NDV毒株F基因序列及其氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析。測(cè)序結(jié)果表明,NDv JZ05株F基因產(chǎn)物F0蛋白酶裂解位點(diǎn)(111~117位)的氨基酸序列為GRROKRF。與18個(gè)NDV毒株F蛋白的氨基酸序列對(duì)比,半胱氨酸殘基數(shù)目和位置完全一致:僅NDV JZ05株發(fā)生半個(gè)氨基酸殘基變更的有5處;而其F蛋白細(xì)胞融合活性位點(diǎn)中的一些保守氨基酸殘基都沒有發(fā)生變更。10個(gè)毒株(Ch98、Ch2000、YN、JZ05、J501、GD05、SCL03、SSX03、Lye01、TW)之間全長(zhǎng)氨基酸序列的同源性均在96%以上,這10個(gè)毒株與3個(gè)疫苗毒株(IdSota、B1、Clonc30)的同源性在88.07%~89.51%。
關(guān)鍵詞:新城疫病毒;F基因;基因克隆;序列分析
中圖分類號(hào):S852.65.+9.5;Q503 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2009)02-0267-05
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