摘要:以PCR擴增新城疫病毒JZ05株的F基因,井進行克隆和測序。采用DNAssist序列分析軟件將JZ05毒株F基因與另外18個NDV毒株F基因序列及其氨基酸序列進行比對分析。測序結(jié)果表明,NDv JZ05株F基因產(chǎn)物F0蛋白酶裂解位點(111~117位)的氨基酸序列為GRROKRF。與18個NDV毒株F蛋白的氨基酸序列對比,半胱氨酸殘基數(shù)目和位置完全一致:僅NDV JZ05株發(fā)生半個氨基酸殘基變更的有5處;而其F蛋白細胞融合活性位點中的一些保守氨基酸殘基都沒有發(fā)生變更。10個毒株(Ch98、Ch2000、YN、JZ05、J501、GD05、SCL03、SSX03、Lye01、TW)之間全長氨基酸序列的同源性均在96%以上,這10個毒株與3個疫苗毒株(IdSota、B1、Clonc30)的同源性在88.07%~89.51%。
關(guān)鍵詞:新城疫病毒;F基因;基因克?。恍蛄蟹治?/p>
中圖分類號:S852.65.+9.5;Q503 文獻標識碼:A 文章編號:0439-8114(2009)02-0267-05
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