ISSR(inter simple sequeence repeat)技術(shù)是建立在PCR基礎(chǔ)上的一種分子標(biāo)記技術(shù)，自1994年建立以來，已廣泛應(yīng)用于生物遺傳多樣性及品種鑒定研究，并作為構(gòu)建遺傳圖譜的工具。其優(yōu)點在于：不需要事先知道靶序列；由于較高的退火溫度和更長的引物序列，可產(chǎn)生重復(fù)性好的擴(kuò)增帶：模板需要量少，多態(tài)性豐富，結(jié)果記錄方便。ISSR—PCR體系的專屬性比較強(qiáng)，不同種植物甚至不同的引物。其反應(yīng)體系有一定差異，只有在最佳條件下，才能獲得穩(wěn)定清晰的多態(tài)性條帶。