中國科技部是國務院主管國家科學技術工作的部門,其前身是1956年5月成立的國家科學技術委員會。1970年6月，中央撤銷該機構。1977年9月科學技術委員會得以恢復。1978年，改為國家科學技術委員會。

1998年3月，國家科學技術委員會更名為中華人民共和國科學技術部。現(xiàn)在其功能有二：一是統(tǒng)籌科技政策、科技規(guī)劃；二是組織科技項目、分配科技資金。

歷史上的國家科委和科技部，其管理職能也經(jīng)歷了不同的階段。

上世紀五六十年代，國家科委并不管理中國科技經(jīng)費，主要是行政管理和綜合協(xié)調(diào)。經(jīng)費使用都是由項目承擔單位直接向國務院申請。

科技部的經(jīng)費管理功能，是隨著時代發(fā)展衍生出來。上世紀80年代初期的國家科委主要履行行政職能。比如，那時的國家科委還管轄現(xiàn)在的地震局、海洋局、知識產(chǎn)權局、科技干部管理等，基本上還是一個宏觀協(xié)調(diào)組織的部門，對于其它部委如教育部的科研院所等，也有業(yè)務指導的功能，但對于科技經(jīng)費的干預并不大。

1986年1月23日由國務院頒布的《國務院關于科學技術撥款管理的暫行規(guī)定》，使科委一舉成為“控制大量科技經(jīng)費”的部門，其中第四條內(nèi)容為：

“國務院各部門科研事業(yè)費，以一九八五年度調(diào)整預算數(shù)(扣除一次性撥款，不扣除因進行改革試點而減發(fā)的撥款)，加上一九八五年因工資改革按規(guī)定應由財政負擔的經(jīng)費為基數(shù)，連同增長的額度，自一九八六年度起，由財政部全部撥交國家科委統(tǒng)一管理。”

這條內(nèi)容，決定性地改變了“國務院各部門科研事業(yè)費”的流程。此前，各部門直接對財政部；1986年度以后，“由財政部全部撥交國家科委統(tǒng)一管理”。

那么，彼時國家科委，怎么對科研事業(yè)費“統(tǒng)一管理”呢？

第五條清楚地指出：

“各類科研單位的科研事業(yè)費，按下列規(guī)定管理：

(一)主要從事技術開發(fā)工作和近期可望取得實用價值的應用研究工作的單位，國家撥給的科研事業(yè)費在“七五”期間逐年減少，直至完全或基本停撥。

(二)主要從事基礎研究和近期尚不能取得實用價值的應用研究工作的單位，其研究經(jīng)費應該逐步作到主要依靠申請基金，國家只撥給一定額度的事業(yè)費，以保證必要的經(jīng)常費用和公共設施費用。

……

(五)科研單位減下來的科研事業(yè)費，三分之二留給國務院主管部門用于行業(yè)技術工作和國家重大科研項目，三分之一由國家科委用作面向全國的科技委托信貸資金和科技貸款的貼息資金……”

由這個文件可以明顯看出，這項旨在“放活科研機構、放活科研人員”的撥款制度改革，落實到利益分配層面，就是將科研單位原有的科研事業(yè)費，或者停撥或者減少，改為重大科研項目經(jīng)費和信貸資金——原來的科研事業(yè)費是可以定期劃撥的，如今，一紙文件，使得科研機構和科技人員，不得不通過申請科技資金項目的方式，來維持科研的持續(xù)和發(fā)展。

這種并無增量、只對存量進行調(diào)整的改革，涉及的核心是利益再分配。原有既得利益集團(科研機構和科研工作者)是客觀存在，撥款制度改革將其原有的利益改變?yōu)橛煽萍疾靠刂频睦?，對于原有利益集團積極性自然調(diào)動不夠；再者，大部分減撥經(jīng)費并沒有進入新機制，仍然條塊分割，對創(chuàng)新的產(chǎn)權、市場、企業(yè)、政府激勵改善也不大，資源利用效率改觀也不大。

但是，此種分配制度的改革，在使國家科委成為最容易為人詬病的經(jīng)費管理者的同時，為此后一系列問題的發(fā)生，埋下了重重伏筆。