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        和田羊FGF5基因RNA干擾載體構(gòu)建及篩選

        2023-10-11 07:38:20曹少奇陳巖高新梅喻恒彬王靜胡廣東
        現(xiàn)代畜牧獸醫(yī) 2023年9期
        關(guān)鍵詞:生長

        曹少奇,陳巖,高新梅,喻恒彬,王靜*,胡廣東*

        ( 1.新疆維吾爾自治區(qū)畜牧總站,新疆 烏魯木齊 830000 ; 2.石河子大學(xué)動物科技學(xué)院,新疆 石河子 832061 )

        和田羊是歷史悠久的地方半粗毛羊品種,但由于育種工作落后,導(dǎo)致生產(chǎn)性能發(fā)生退化。因此,對控制和田羊羊毛的性狀相關(guān)基因進(jìn)行深入研究,進(jìn)一步改善和田羊的羊毛品質(zhì),對和田羊種質(zhì)資源的開發(fā)與保護(hù)具有重要意義[1]。毛囊是支持哺乳動物毛發(fā)形成和生長的重要器官,其周期受血管內(nèi)皮細(xì)胞生長因子[2]、骨形態(tài)發(fā)生蛋白4[3]、胰島素樣生長因子1[4]、FGF5[5]等多種信號分子的調(diào)控,F(xiàn)GF5是控制毛囊從生長期向退行期轉(zhuǎn)換的關(guān)鍵因子[6]。FGF5由3個外顯子和兩個內(nèi)含子構(gòu)成,具有調(diào)控毛囊周期的功能,是調(diào)節(jié)毛發(fā)生長的重要因子之一。在對小鼠、驢、犬、貓、人的試驗(yàn)中均發(fā)現(xiàn)FGF5基因的表達(dá)量與毛發(fā)生長有關(guān),也有研究發(fā)現(xiàn)FGF5基因的表達(dá)與絨山羊的羊絨生長有關(guān)[7]。綜上,沉默或敲除FGF5因子研究其對動物產(chǎn)毛性狀的影響,對提高產(chǎn)毛動物的毛產(chǎn)量具有重要意義。

        對絨山羊中使用RNAi技術(shù)進(jìn)行FGF5敲除試驗(yàn),結(jié)果表明,RNAi技術(shù)可有效降低FGF5的表達(dá)[8-9],且FGF5敲除后對絨山羊的血液生理生化指標(biāo)[10]、發(fā)情能力[11]無顯著影響。本研究中設(shè)計(jì)并合成了4個shRNA,將其與pGPU6/GFP/Neo質(zhì)粒連接構(gòu)建干擾表達(dá)載體,將干擾載體轉(zhuǎn)染至和田羊成纖維細(xì)胞,檢測其對和田羊FGF5基因的mRNA和蛋白表達(dá)水平的干擾效率,篩選出干擾效率最強(qiáng)的shRNA,為進(jìn)一步探討和田羊中FGF5基因的作用機(jī)制、改善和田羊毛質(zhì)量奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)用和田羊由石河子大學(xué)獸醫(yī)站飼養(yǎng),剪取和田羊耳部組織分離培養(yǎng)獲得成纖維細(xì)胞。

        大腸桿菌DH5α購自天根公司;質(zhì)粒pGPU6/GFP/Neo購自上海吉瑪技術(shù)有限公司。

        胎牛血清(FBS)、DMEM培養(yǎng)基、0.25%胰蛋白酶購自Gibco;20×PBS、質(zhì)粒提取試劑盒(上海生工生物工程有限公司);青霉素-鏈霉素(HyClone);Trizol(Invitrogen公司);反轉(zhuǎn)錄試劑盒、熒光定量試劑盒(TaKaRa公司);抗GADPH鼠單克隆抗體、抗FGF5鼠單克隆抗體、辣根過氧化物酶標(biāo)記山羊抗小鼠IgG(Abcam公司)。

        CO2培養(yǎng)箱(Thermo公司)、超凈工作臺(日本日立公司)、LightCycler 96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(羅氏公司);垂直電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、半干轉(zhuǎn)膜儀(美國BIO-RAD公司);水平板電泳儀(上海天能科技有限公司)。

        1.2 和田羊FGF5基因靶向寡核苷酸的設(shè)計(jì)與制備

        依據(jù)和田羊FGF5基因CDS區(qū)與shRNA的設(shè)計(jì)原則,使用Life Technologies公司網(wǎng)站(http://www.lifetechnologies.com/cn/zh/home/brands/ambion.html)中的shRNA target design工具,設(shè)計(jì)得到4條長度為54 bp的shRNA干擾片段PR-FGF1、PR-FGF2、PR-FGF3、PR-FGF4和1條長度為51 bp的陰性對照片段PR-FGF5,片段序列信息見表1。

        表1 FGF5 RNA干擾片段序列信息Tab.1 FGF5 RNA interference fragment sequence information

        shRNA干擾片段上下游分別引入BamH Ⅰ酶切位點(diǎn)和Bbs Ⅰ酶切位點(diǎn),由上海生工生物工程有限公司合成相應(yīng)的shDNA單鏈。

        1.3 RNA干擾載體的構(gòu)建

        將所得的單鏈shDNA使用20 μL體系(Sense 1 μL、10×SSC 1 μL、Anti-Sence 1 μL、ddH2O補(bǔ)齊)進(jìn)行退火連接;反應(yīng)條件為95 ℃變性10 min,室溫冷卻1 h;獲得雙鏈shDNA。

        4條干擾片段分別命名為shRNA-FGF1、shRNAFGF2、shRNA-FGF3、shRNA-FGF4,陰性對照片段命名為shRNA-FGF5。使用限制性內(nèi)切酶BamH Ⅰ和Bbs Ⅰ對質(zhì)粒pGPU6/GFP/Neo進(jìn)行雙酶切鑒定,1%瓊脂糖凝膠電泳對酶切產(chǎn)物進(jìn)行回收,得到線性化的質(zhì)粒pGPU6/GFP/Neo。將合成的5條雙鏈shDNA,分別與線性化的pGPU6/GFP/Neo質(zhì)粒4 ℃過夜連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入感受態(tài)細(xì)胞中,過夜挑取單菌落至培養(yǎng)管,搖菌擴(kuò)大培養(yǎng),進(jìn)行質(zhì)粒提取后獲得重組質(zhì)粒。重組質(zhì)粒利用BamH Ⅰ進(jìn)行單酶切鑒定后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定,送至上海生工生物工程有限公司測序。

        1.4 重組質(zhì)粒酶切鑒定

        重組質(zhì)粒酶切體系為:10×buffer H 1 μL,BamH Ⅰ酶0.5 μL,BSA(10 g/L)0.25 μL,質(zhì)粒4 μL,滅菌超純水補(bǔ)至10 μL。離心混勻后,置37 ℃水浴2 h;65 ℃經(jīng)10 min滅活內(nèi)切酶,10 g/L瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

        1.5 細(xì)胞培養(yǎng)和細(xì)胞轉(zhuǎn)染

        采取和田羊耳部組織塊,使用PBS溶液(含有50萬單位青霉素-鏈霉素)清洗,之后用75%酒精浸泡2 min,再次使用PBS溶液仔細(xì)清洗。在超凈工作臺中將組織塊表皮去除,在PBS溶液中將組織塊剪碎至糊狀,使用PBS溶液離心清洗3~5遍,胰酶消化后再次使用PBS溶液離心清洗3~5遍,將清洗后的組織塊種至60 mm培養(yǎng)皿中,在細(xì)胞培養(yǎng)箱(37 ℃、5% CO2)中放置5 min,待組織塊貼壁后取出,在培養(yǎng)皿中添加含有10% FBS的DMEM/DF12完全培養(yǎng)基(含有20萬單位青霉素-鏈霉素),放入細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),2 d后更換培養(yǎng)基,4 d后可見耳部組織塊周圍遷移出成纖維細(xì)胞,2 d更換一次培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)至細(xì)胞數(shù)量可用。利用電刺激轉(zhuǎn)染的方式將5種RNA干擾載體轉(zhuǎn)染至成纖維細(xì)胞,24 h后觀察綠色熒光蛋白GFP6表達(dá)情況。

        1.6 RT-PCR檢測FGF5 mRNA表達(dá)水平

        電轉(zhuǎn)染24 h后,使用TRIzol試劑盒提取各組細(xì)胞的總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA通過RT-PCR檢測細(xì)胞樣品中FGF5基因表達(dá)量,重復(fù)3次。定量引物序列為:AAGACTGGGCGGGAGTGGTA;GGCTTGACGGGATTAGGTG。采用2-ΔΔCt法計(jì)算FGF5基因的相對表達(dá)量。

        1.7 WB檢測FGF5蛋白表達(dá)水平

        電轉(zhuǎn)染36 h后,棄掉培養(yǎng)液,使用RIPA裂解液裂解各組細(xì)胞提取細(xì)胞總蛋白,BCA蛋白定量試劑盒測定總蛋白濃度并計(jì)算出SDS-PAGE電泳上樣量,電泳至溴酚藍(lán)剛跑出,半干轉(zhuǎn)法轉(zhuǎn)膜,之后用5%脫脂奶粉室溫?fù)u床孵育,封閉1 h。剪取一次性塑料手套指頭部分,將膜放入其中,將稀釋好的一抗滴到膜上,使用封口機(jī)封口,4 ℃過夜孵育。TBST洗膜2次,向50 mL離心管中加入稀釋過的二抗,將膜放入其中,室溫?fù)u床孵育1 h,TBST洗膜2次。使用HRP-ECL發(fā)光法進(jìn)行鑒定,確定FGF5蛋白表達(dá)量。

        1.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

        使用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對轉(zhuǎn)染后的成纖維細(xì)胞中FGF5基因表達(dá)量進(jìn)行單因素方差分析。P<0.05表示顯著差異,P<0.01表示極顯著差異。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 和田羊FGF5基因shRNA干擾載體的構(gòu)建與鑒定結(jié)果

        將合成的5條寡聚核苷酸片段與pGPU6/GFP/Neo載體連接,轉(zhuǎn)化、挑菌、搖菌、質(zhì)粒提取,獲得重組質(zhì)粒。重組質(zhì)粒利用BamH Ⅰ進(jìn)行單酶切鑒定,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定,重組質(zhì)粒pGPU6-shRNA BamH Ⅰ單酶切鑒定結(jié)果見圖1。

        圖1 重組質(zhì)粒pGPU6-shRNA BamH I單酶切鑒定Fig.1 Gel electrophoresis of recombinant interference vector with single enzyme digestion

        由圖1可知,BamH Ⅰ單酶切后5個重組質(zhì)粒均只出現(xiàn)1條條帶,且大小符合預(yù)期。將提取的質(zhì)粒送公司測序,測序結(jié)果與設(shè)計(jì)序列相符,表明4個干擾表達(dá)載體均構(gòu)建成功,pGPU6-shRNA載體圖譜見圖2。

        圖2 pGPU6-shRNA載體圖譜Fig.2 PGPU6-shRNA vector map

        將5個pGPU6-shRNA的載體分別命名為pGPU6-shRNA-FGF1(即PR-FGF1)、pGPU6-shRNA-FGF2(即PR-FGF2)、pGPU6-shRNA-FGF3(即PR-FGF3)、pGPU6-shRNA-FGF4(即PR-FGF4)、pGPU6-shRNAFGF5(即PR-FGF5)。

        2.2 綿羊耳部成纖維原代細(xì)胞及質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞(見圖3)

        圖3 綿羊耳部成纖維原代細(xì)胞及質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞Fig.3 Sheep ear fibroblasts primary cells and plasmid transfected cells

        由圖3(a)可知,培養(yǎng)2 d后組織塊周圍遷移出綿羊耳部成纖維細(xì)胞;由圖3(b)可知,組織塊培養(yǎng)培養(yǎng)4 d后成纖維細(xì)胞的細(xì)胞密度約為80%。

        利用電激轉(zhuǎn)染的方式將5種RNA干擾載體轉(zhuǎn)染至成纖維細(xì)胞,24 h后通過熒光顯微鏡觀察熒光情況。

        由圖3(c)、3(d)可知,轉(zhuǎn)染后細(xì)胞可見綠色熒光,表明成纖維細(xì)胞中開始表達(dá)外源綠色熒光蛋白,干擾載體轉(zhuǎn)染成功。

        2.3 干擾載體對FGF5基因沉默效率檢測結(jié)果

        以轉(zhuǎn)染陰性質(zhì)粒PR-FGF5的成纖維細(xì)胞為對照,采用qRT-PCR檢測成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)染4個干擾載體和陰性質(zhì)粒后FGF5基因mRNA表達(dá)量,結(jié)果見圖4。

        圖4 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后FGF5 mRNA表達(dá)量Fig.4 Expression of FGF5 mRNA after transfection with recombinant plasmid

        由圖4可知,4個shRNA干擾表達(dá)載體均能夠不同程度干擾成纖維細(xì)胞中FGF5 mRNA的表達(dá)。PR-FGF1組、PR-FGF2組、PR-FGF3組、PR-FGF4組干擾效率分別為23.91%、58.85%、85.20%、43.59%,均顯著低于PR-FGF5組(P<0.05),其中重組質(zhì)粒PR-FGF3對FGF5基因的干擾效率最高。

        以轉(zhuǎn)染陰性質(zhì)粒PR-FGF5的成纖維細(xì)胞為對照,以GAPDH為內(nèi)參蛋白,采用WB檢測成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)染4個干擾載體和陰性質(zhì)粒后FGF5蛋白表達(dá)量,結(jié)果見圖5。

        圖5 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后FGF5蛋白表達(dá)量Fig.5 Expression level of FGF5 protein after transfection with recombinant plasmid

        由圖5可知,與PR-FGF5組相比,PR-FGF1組、PRFGF2組、PR-FGF3組、PR-FGF4組中FGF5蛋白表達(dá)量均明顯降低。其中,PR-FGF3組中FGF5蛋白表達(dá)量降低最顯著,WB結(jié)果與qRT-PCR結(jié)果趨勢相同。

        結(jié)果表明,PR-FGF3 RNA干擾片段抑制FGF5基因表達(dá)效果最佳。

        3 討論

        成纖維細(xì)胞生長因子(FGFs)屬于多肽類生長因子,通過與酪氨酸激酶型FGF受體(FGFRs)結(jié)合發(fā)揮作用[12]。目前在單細(xì)胞動物中并未發(fā)現(xiàn)FGFs基因,已發(fā)現(xiàn)的FGFs與FGFR基因全部存在于多細(xì)胞動物中。線蟲中存在兩種FGFs,人和小鼠中存在23種FGFs,因此,F(xiàn)GFs基因種類可能隨著生物的進(jìn)化不斷增多,并構(gòu)成越來越復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),參與更多的生物學(xué)功能。據(jù)此,深入研究FGFs及其受體FGFRs基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)將為研究動物生長、生理調(diào)控過程和演化中生物功能的變化奠定基礎(chǔ)。

        FGF5是FGFs家族的一員,廣泛存在于多種哺乳動物中。但有研究發(fā)現(xiàn),不同動物中FGF5蛋白存在明顯的區(qū)別,目前,F(xiàn)GF5在人和小鼠體內(nèi)的主要作用是調(diào)控毛囊生長,是已知最有效的誘導(dǎo)毛囊從生長期轉(zhuǎn)換到休止期的因子。FGF5在毛囊生長期末期高表達(dá),可促進(jìn)毛囊從生長期至退行期的轉(zhuǎn)換,從而抑制毛發(fā)生長[13]。采用RNAi技術(shù)或FGF5抑制劑對FGF5基因進(jìn)行抑制后,F(xiàn)GF5蛋白表達(dá)量降低,毛囊生長期被延長。

        與野生型小鼠相比,通過基因打靶技術(shù)敲除FGF5基因的小鼠毛發(fā)生長速度明顯升高[14],F(xiàn)GF5基因敲除的綿羊羊毛長度和產(chǎn)量均有所提高[15]。研究表明,F(xiàn)GF5抑制因子對人類脫發(fā)具有治療效果[16],也可以促進(jìn)小鼠毛發(fā)生長[17]。FGF5能夠改變真皮乳頭細(xì)胞的活性,抑制真皮乳頭細(xì)胞介導(dǎo)的外跟梢細(xì)胞的增殖,進(jìn)而調(diào)控毛囊周期,抑制毛發(fā)生長,誘導(dǎo)毛發(fā)再生[18]。研究發(fā)現(xiàn),將綿羊的FGF5敲除后,F(xiàn)GFR1、雄激素、Wnt/β-catenin、Shh/Gli2、c-MYC等因子產(chǎn)生了變化并存在一些相互作用[19]。有研究表明,F(xiàn)GF5可影響綿羊毛囊發(fā)育與毛發(fā)生長[20]。綜上所述,在生物、細(xì)胞、分子水平上繼續(xù)深入研究FGF5對毛發(fā)發(fā)育的影響具有重要的意義和較高的可行性。

        本研究通過RNAi技術(shù)構(gòu)建并篩選出了干擾效率達(dá)到85.2%的和田羊成纖維細(xì)胞FGF5基因干擾載體,可作為后續(xù)和田羊FGF5的RNAi序列,為研究FGF5對和田羊羊毛生長的調(diào)控、改善和田羊羊毛質(zhì)量提供技術(shù)支持。在此基礎(chǔ)上,可進(jìn)一步在其他毛囊相關(guān)細(xì)胞中進(jìn)行FGF5敲除試驗(yàn),以探究FGF5在毛囊周期調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用;同時(shí)可將FGF5基因干擾與FGF5抑制劑進(jìn)行對比,探究FGF5抑制劑應(yīng)用于和田羊毛生產(chǎn)的可能性。

        4 結(jié)論

        本研究構(gòu)建并篩選出了和田羊FGF5基因的干擾表達(dá)載體,經(jīng)細(xì)胞驗(yàn)證可高效干擾和田羊FGF5基因的表達(dá),可應(yīng)用于和田羊FGF5基因功能的研究中。

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