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        圍生期缺血缺氧性腦病的微RNA生物標(biāo)志物篩選研究

        2023-09-04 03:27:06曾浩陳玉霞司文
        安徽醫(yī)藥 2023年9期
        關(guān)鍵詞:病兒內(nèi)皮素臟器

        曾浩,陳玉霞,司文

        圍生期缺氧缺血性腦?。℉IE)主要是指因多種原因共同作用導(dǎo)致的缺氧窒息,繼而引起部分或完全缺氧或(和)腦血流減少導(dǎo)致的腦缺氧缺血性損害[1]。病兒主要表現(xiàn)特征涵蓋意識(shí)障礙、原始反射異常以及肌張力改變等,可能伴有多臟器的不同程度損傷,預(yù)后不良[2]。因此,如何有效早期診斷HIE具有極其重要的意義。既往,臨床上主要是通過(guò)核磁共振以及腦電圖等手段實(shí)現(xiàn)對(duì)HIE的診斷,但均存在耗時(shí)較長(zhǎng)的缺陷,可能導(dǎo)致病兒的最佳治療時(shí)期錯(cuò)過(guò)[3]。因此,利用病兒臍血進(jìn)行快速、準(zhǔn)確、無(wú)創(chuàng)的生物標(biāo)志物檢測(cè)無(wú)疑是最佳的解決方案。目前,高通量測(cè)序以及檢測(cè)技術(shù)得到顯著的發(fā)展,若能通過(guò)上述技術(shù)篩查出臍帶血血液中和缺氧狀態(tài)相關(guān)的生物標(biāo)志物,并結(jié)合高通量自動(dòng)快速檢測(cè)設(shè)備檢測(cè)分子標(biāo)志物可有效提高HIE診斷的準(zhǔn)確性[4],繼而為醫(yī)療手段或神經(jīng)保護(hù)藥物的使用時(shí)機(jī)和藥物劑量提供依據(jù)。本研究通過(guò)HIE的微RNA(miRNA)生物標(biāo)志物的篩選,為臨床治療提供支持。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 通過(guò)動(dòng)態(tài)隊(duì)列研究法獲取深圳市龍華區(qū)中心醫(yī)院2020年1月至2021年1月144例HIE病兒作為受試者。將其根據(jù)病情嚴(yán)重程度的差異分作輕度HIE組42例、中度HIE組62例以及重度HIE組40例,另取同期該院50例健康新生兒作為對(duì)照組。各組基線資料差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),可比性較高,見(jiàn)表1。入組標(biāo)準(zhǔn):(1)HIE病兒均符合中華醫(yī)學(xué)會(huì)兒科學(xué)會(huì)新生兒組修訂的新生兒HIE診斷標(biāo)準(zhǔn)[5];(2)均為足月單胎妊娠;(3)娩出后24 h內(nèi)入院接受診治。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)合并敗血癥或(和)腦膜炎等并發(fā)癥;(2)伴有先天性畸形或遺傳性疾病;(3)正參與其他研究。本研究獲深圳市龍華區(qū)中心醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(批號(hào)2019-072-02),病兒監(jiān)護(hù)人或近親屬對(duì)研究方案簽署知情同意書(shū)。

        表1 各組新生兒基線資料對(duì)比

        1.2 研究方法 (1)臍帶血采集及處理:在受試者娩出之后,分別采集200 μL的臍帶血保存在無(wú)RNA酶EP管內(nèi),滴加1 mL的Trizol LS[賽默飛世爾科技(中國(guó))有限公司]充分混勻,保存至-80 ℃冰箱中備用。(2)總RNA提取:首先將標(biāo)本進(jìn)行冰上溶解處理,滴加200 μL的氯仿混勻,進(jìn)行時(shí)長(zhǎng)為10 min的靜置處理,之后開(kāi)展時(shí)長(zhǎng)為15 min的12 000 r/min離心處理。采集上層水相400 μL并放置在無(wú)RNA酶的EP管內(nèi),繼續(xù)滴加400 μL異丙醇混勻。冰上靜置10 min后以14 000 r/min為離心條件離心15 min。之后去除上清液,取沉淀物加入乙醇清洗后12 000 r/min離心5 min。吸去乙醇,晾干后,加入10 μL去酶水,液氮速凍RNA溶液,樣品用干冰運(yùn)輸交給公司進(jìn)行二代測(cè)序。(3)二代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及差異表達(dá)基因分析:通過(guò)第二代測(cè)序技術(shù)實(shí)現(xiàn),并篩選reads數(shù)>2的差異基因,閾值為FDR(false discovery rate)<0.05,log2FC [fold change (condition 2/condition 1)for a gene]>2或log2FC<-2,根據(jù)以上條件得出差異表達(dá)的miRNA。(4)候選miRNA關(guān)聯(lián)性分析:篩選出與HIE分度正相關(guān)或負(fù)相關(guān)的候選miRNA,通過(guò)兩變量關(guān)聯(lián)性分析方法進(jìn)行分析每個(gè)miRNA與HIE分度的相關(guān)性,將HIE臨床分度為有序分類(lèi)變量并設(shè)為x,臨床分度Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分別對(duì)應(yīng)為值1、2、3,將miRNA的reads數(shù)作為連續(xù)定量變量,設(shè)為y。因雙變量中含有一有序分類(lèi)變量,因此SPSS應(yīng)采用Spearman關(guān)聯(lián)性分析方法進(jìn)行分析其相關(guān)性。根據(jù)其秩相關(guān)系數(shù)rs篩選出3~5個(gè)-1≤rs≤-0.5或1≥rs≥0.5,且P≤0.05的miRNA,作為預(yù)測(cè)HIE的miRNA生物標(biāo)志物。(5)分組方式:將所有HIE病兒按照是否合并臟器損傷分為合并臟器損傷組102例以及未合并臟器損傷組42例。(6)血清誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(iNOS)、內(nèi)皮素-1水平檢測(cè):檢測(cè)方式均為酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定,操作以試劑盒(購(gòu)自上海西唐生物科技有限公司)說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 數(shù)據(jù)處理軟件選擇SPSS 22.0。以表示計(jì)量數(shù)據(jù),開(kāi)展正態(tài)性檢驗(yàn)及方差齊性檢驗(yàn),符合正態(tài)分布,兩組比較行兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。多組間對(duì)比行單因素方差分析。計(jì)數(shù)資料以例(%)表示,開(kāi)展χ2檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1 芯片檢測(cè)結(jié)果分析 miRNA芯片通過(guò)掃描、分析以及標(biāo)準(zhǔn)化處理,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miRNA芯片共檢測(cè)miRNA達(dá)921種。相較于對(duì)照組,HIE病兒血漿中有29種miRNA表達(dá)異常升高,26種miRNA表達(dá)異常下降,選擇差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的miRNA實(shí)施生物學(xué)信息分析,發(fā)現(xiàn)了miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p可能具有潛在的預(yù)測(cè)HIE作用。

        2.2 各組新生兒miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p表達(dá)對(duì)比 重度HIE組miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p表達(dá)水平均高于對(duì)照組和輕度HIE組以及中度組,且輕度HIE組、中度HIE組miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p表達(dá)水平均高于對(duì)照組,中度HIE組miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p表達(dá)水平均高于輕度HIE組(均P<0.05),見(jiàn)表2。

        表2 各組新生兒miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p表達(dá)對(duì)比/

        表2 各組新生兒miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p表達(dá)對(duì)比/

        注:HIE為缺氧缺血性腦病。①與對(duì)照組相比,P<0.05。②與輕度HIE組相比,P<0.05。③與中度HIE組相比,P<0.05。

        miR-6794-5p 0.47±0.11 0.89±0.15①1.46±0.20①②2.24±0.24①②③16.40<0.001組別對(duì)照組輕度HIE組中度HIE組重度HIE組F值P值例數(shù)50 42 62 40 miR-4472 0.20±0.04 0.37±0.08①0.55±0.09①②0.71±0.12①②③10.53<0.001 miR-5195-3p 0.78±0.15 0.92±0.18①1.45±0.23①②2.34±0.28①②③14.29<0.001

        2.3 HIE病兒病情嚴(yán)重程度和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)的關(guān)系分析 HIE病兒病情嚴(yán)重程度和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)均呈正相關(guān)關(guān)系(均P<0.05),見(jiàn)表3。

        表3 HIE病兒病情嚴(yán)重程度和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)的Spearman相關(guān)性分析

        2.4 HIE病兒合并臟器損傷和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)的關(guān)系分析 合并臟器損傷HIE病兒miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)水平均高于未合并臟器損傷組(均P<0.05),見(jiàn)表4。

        表4 HIE病兒合并臟器損傷和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)的關(guān)系分析/

        表4 HIE病兒合并臟器損傷和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)的關(guān)系分析/

        注:HIE為缺氧缺血性腦病。

        組別合并臟器損傷組未合并臟器損傷組t值P值miR-6794-5p 1.70±0.31 1.37±0.23 6.22<0.001例數(shù)102 42 miR-4472 0.60±0.09 0.46±0.03 9.84<0.001 miR-5195-3p 2.05±0.18 1.58±0.12 15.54<0.001

        2.5 兩組血清iNOS及內(nèi)皮素-1水平對(duì)比 HIE組血清iNOS及內(nèi)皮素-1水平均高于對(duì)照組(均P<0.05),見(jiàn)表5。

        表5 兩組血清iNOS及內(nèi)皮素-1水平對(duì)比/

        表5 兩組血清iNOS及內(nèi)皮素-1水平對(duì)比/

        注:HIE為缺氧缺血性腦病,iNOS為一氧化氮合酶。

        組別對(duì)照組HIE組t值P值內(nèi)皮素-1/(ng/L)34.58±9.28 241.93±32.15 44.89<0.001例數(shù)50 144 iNOS/(U/mL)21.05±3.16 47.11±6.23 28.31<0.001

        3 討論

        臨床表現(xiàn)、影像學(xué)檢查和腦電圖檢查是目前臨床上廣泛用以診斷HIE的手段,但其無(wú)法判斷腦缺氧缺血后的損傷實(shí)質(zhì),且靈敏度以及特異度均較低,對(duì)后續(xù)治療用藥影響較大,存在一定的局限性[6-8]。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的日益發(fā)展,大規(guī)模人群樣本的疾病相關(guān)生物標(biāo)志物篩選得以實(shí)現(xiàn)[9-10]。生物標(biāo)志物可反映生理狀態(tài)或疾病過(guò)程中細(xì)胞變化情況,包括miRNA、細(xì)胞代謝物以及蛋白質(zhì)等小分子,可用于預(yù)測(cè)患病概率、輔助診斷以及預(yù)后評(píng)估中。其中miRNA主要是指一類(lèi)約由20個(gè)核苷酸組成的非編碼RNA,其可通過(guò)和靶mRNA的互補(bǔ)序列特異性結(jié)合,繼而調(diào)控相關(guān)靶基因的表達(dá),進(jìn)一步參與多種疾病的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程[11-12]。有研究報(bào)道顯示,miRNA與人類(lèi)癌癥、中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病以及心血管疾病均有密切相關(guān),可能是多種疾病診斷、治療以及預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物[13-14]。

        本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),相較于對(duì)照組,HIE病兒血漿中有29種miRNA表達(dá)異常升高,26種miRNA表達(dá)異常下降。這在既往相關(guān)研究報(bào)道中得以佐證,說(shuō)明了存在一部分miRNA和HIE的發(fā)生、發(fā)展有關(guān)。然而,另有研究報(bào)道發(fā)現(xiàn)miRNA-210在HIE中存在異常表達(dá)[15],而在本研究中并未檢測(cè)到該miRNA的異常改變。導(dǎo)致上述差異發(fā)生的原因可能和醫(yī)療技術(shù)的飛速發(fā)展以及醫(yī)療條件的日益完善有關(guān);此外,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中難免存在一定的偏倚,從而導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)偏頗。此外,miR-4472、miR-5195-3p以及miR-6794-5p可能具有潛在的預(yù)測(cè)HIE作用,且上述3種miRNA在HIE病兒中均存在異常高表達(dá),并隨著HIE病兒病情的加重,其表達(dá)升高。提示了miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p可能是HIE的miRNA生物標(biāo)志物。究其原因,上述3種miRNA可通過(guò)調(diào)控下游靶基因的表達(dá),進(jìn)一步參與HIE的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程。然而,關(guān)于其具體作用機(jī)制有待進(jìn)一步研究明確,亦為我們今后的研究提供了新的方向以及思路。另外,合并臟器損傷HIE病兒合并臟器損傷和miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)水平均高于未合并臟器損傷組。分析原因,可能是上述3種miRNA參與了HIE各臟器損傷的病理過(guò)程[16-17]。這反映了上述3種miRNA表達(dá)水平的檢測(cè)可能有助于臨床預(yù)測(cè)HIE病兒的合并臟器損傷情況,可為已出現(xiàn)多臟器功能不全趨勢(shì)但尚未出現(xiàn)顯著表現(xiàn)病人提供早期預(yù)警指導(dǎo),繼而為臨床診治提供指導(dǎo)依據(jù),達(dá)到改善預(yù)后的目的。然而,miRNA在心肌缺氧缺血損傷以及其他多種情況下降均可能出現(xiàn)異常表達(dá)[18-19],因此,需開(kāi)展進(jìn)一步試驗(yàn)明確各臟器組織特異相關(guān)的miRNA表達(dá)。此外,本研究所檢測(cè)的樣本為臍帶血,其中miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p表達(dá)可能受多種因素的干擾,今后的研究可以考慮采集多種不同類(lèi)型標(biāo)本進(jìn)行試驗(yàn),提高數(shù)據(jù)的可信度。HIE組血清iNOS及內(nèi)皮素-1水平均高于對(duì)照組??紤]原因,可能是iNOS和內(nèi)皮素-1在HIE的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中具有調(diào)節(jié)平衡作用。

        綜上所述,miR-4472、miR-5195-3p、miR-6794-5p可能是HIE的潛在miRNA生物標(biāo)志物,上述miRNA表達(dá)水平和病兒病情嚴(yán)重程度以及臟器損傷有關(guān),可能有助于輔助診斷HIE以及預(yù)測(cè)臟器損傷發(fā)生情況,值得臨床重點(diǎn)關(guān)注。然而,本研究尚且存在一定的有待完善之處,在今后的相關(guān)研究中,應(yīng)增加樣本量,以獲取更為準(zhǔn)確、可靠的數(shù)據(jù)。

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