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        利用CRISPR/Cpf1系統(tǒng)構(gòu)建人ABCG1和ABCG4基因敲除的293T細(xì)胞株

        2019-05-14 11:22:22覃鴻妮謝鈺珍蔡一林
        西南農(nóng)業(yè)學(xué)報 2019年4期
        關(guān)鍵詞:靶位單克隆細(xì)胞株

        覃鴻妮,謝鈺珍,馬 傲,蔡一林

        (1. 蘇州工業(yè)園區(qū)服務(wù)外包職業(yè)學(xué)院,江蘇 蘇州 215123;2.金唯智生物科技有限公司,江蘇 蘇州 215123;3. 西南大學(xué)玉米研究所,重慶 400716)

        【研究意義】三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運蛋白(ATP-binding cassette, ABC)超家族含有1個三磷酸腺苷(ATP)結(jié)合盒,可通過利用ATP水解過程釋放的能量在溶質(zhì)中跨膜轉(zhuǎn)運各種生物分子[1]。ABC轉(zhuǎn)運蛋白在腦組織中膽固醇的膜外轉(zhuǎn)運和維持穩(wěn)態(tài)中起著重要的調(diào)節(jié)作用。細(xì)胞內(nèi)膽固醇主要通過SR-BI介導(dǎo)的雙向轉(zhuǎn)運模式,主動擴(kuò)散以及由ABC轉(zhuǎn)運蛋白介導(dǎo)的膽固醇單向跨膜轉(zhuǎn)運機(jī)制排出胞外[2-3]。ABC轉(zhuǎn)運蛋白根據(jù)其結(jié)構(gòu)域和氨基酸同源性可分為ABCA~ABCG亞家族7個亞家族,人類基因組共包含48個具有轉(zhuǎn)錄活性的ABC轉(zhuǎn)運蛋白轉(zhuǎn)運子基因。ABCG1和ABCG4均為ABC 轉(zhuǎn)運體超家族的成員?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】研究表明,ABCG1基因可廣泛表達(dá)于各種人和巨噬細(xì)胞及小鼠組織中,能有效調(diào)節(jié)神經(jīng)膽固醇的流動。Northern印跡分析顯示人ABCG4 mRNA僅在大腦和眼睛的神經(jīng)視網(wǎng)膜中高度表達(dá),且ABCG4和ABCG1共有74 %的氨基酸序列同源性,所以ABCG4也可以促進(jìn)膽固醇流向高密度脂蛋白(HDL)。目前關(guān)于ABCG1和ABCG4的功能研究還存在諸多問題,例如,對于ABCG1在動脈粥樣硬化(AS)發(fā)病過程中的確切作用機(jī)制仍存在爭議;ABC家族成員之間的相互作用關(guān)系仍有待進(jìn)一步研究;動物模型的實驗結(jié)果應(yīng)用于人時存在一定的局限性;ABCG4轉(zhuǎn)運子在腦細(xì)胞的特殊定位和功能分析,特別是ABCG4轉(zhuǎn)運子在腦脂質(zhì)動態(tài)平衡與神經(jīng)系統(tǒng)疾病方面的功能還有待進(jìn)一步闡明[4]。2012 年起 CRISPR/Cas9 被改造為基因編輯工具,可高效、便捷地完成基因定點突變、片段的敲除或敲入等[5-6]。【本研究切入點】CRISPR/Cpf1系統(tǒng)是在CRISPR/Cas9系統(tǒng)的研究基礎(chǔ)上,發(fā)現(xiàn)的一種新型基因編輯技術(shù)。Cpf1相對于Cas9具有更高的特異性,比CRISPR/Cas9更適用于精確的基因組編輯,因此其在疾病模型建立、抗癌藥物研制、干細(xì)胞治療等生物和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用潛力。如何將CRISPR/Cpf1技術(shù)應(yīng)用于疾病治療,以及由此引發(fā)的安全性和倫理問題,也都需要更加深入的研究和規(guī)則的制定加以解決[7-9]。【擬解決的關(guān)鍵問題】本研究利用CRISPR/Cpf1基因組編輯技術(shù),建立成熟的CRISPR/Cpf1基因敲除系統(tǒng),為同類或其他基因的敲除提供借鑒;通過實現(xiàn)對細(xì)胞中ABCG1和ABCG4基因敲除模型的建立,為進(jìn)一步研究細(xì)胞中膽固醇代謝的調(diào)節(jié)作用提供幫助,從而加快相關(guān)的醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用研究的進(jìn)展。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        人胚腎細(xì)胞株(293T)購于協(xié)和大學(xué) (美國) 細(xì)胞庫,Crispr/Cpf1質(zhì)粒, Ascpf1和Lbcpf1載、Top10感受態(tài)細(xì)胞由金唯智生物科技有限公司構(gòu)建;5×pfu buffer(通用)、10×pfu buffer(通用)、1×稀釋 buffer、PBS、pfu DNA聚合酶、TaqDNA聚合酶、T4連接酶均由由蘇州金唯智公司試劑組配制;BsmB1(ESP31)限制性內(nèi)切酶購自thermo公司;T7E1限制性核酸內(nèi)切酶購自北京唯尚立德公司;FBS(胎牛血清)購自BI(Biological Industrics)公司;DMEM高糖培養(yǎng)基購自HYClone公司;DNA凝膠回收試劑盒、質(zhì)粒小量抽提試劑盒均購自AXYGEN公司;細(xì)胞基因組DNA抽提試劑盒購自TIANGEN公司。

        1.2 方法

        1.2.1 sgRNA引物的設(shè)計與合成 使用NCBI數(shù)據(jù)庫下載ABCG1和ABCG4基因組完整序列,使用CRISPR在線設(shè)計工具(http://chopchop.cbu.uib.no/),分別在ABCG1和ABCG4蛋白質(zhì)編碼區(qū)(CDS區(qū))前7個外顯子設(shè)計sgRNA,根據(jù)網(wǎng)站設(shè)計的結(jié)果,選取2對得分較高的序列,在其兩端加上酶切位點,在每條sgRNA序列的F鏈5’端添加AAAA,R鏈的5’端添加AGAT, 目的是與AsCpf1/LbCpf1質(zhì)粒在BsmB1(ESP31)酶切后形成的黏性末端互補(表1)。引物序列由金唯智生物科技有限公司合成。

        1.2.2 載體的構(gòu)建及鑒定 AsCpf1/LbCpf1載體為含U6啟動子(啟動SgRNA)表達(dá)載體,其本身可以表達(dá)Cpf1酶,并具有卡那青霉素和嘌呤霉素篩選抗性。將ABCG1和ABCG4的2對sgRNA寡核苷酸單鏈分別退火合成雙鏈,用T4連接酶和BsmB1(ESP31)限制性內(nèi)切酶將退火后的引物通過邊切邊連的方法連接到AsCpf1/LbCpf1載體,構(gòu)建AsCpf1-ABCG1-sgRNA1、LbCpf1-ABCG1-sgRNA2、AsCpf1-ABCG4-sgRNA1和LbCpf1-ABCG4-sgRNA2重組質(zhì)粒;取連接產(chǎn)物10 μl轉(zhuǎn)化至Top10 F’感受態(tài)細(xì)胞中,在Kan抗性的LB平板上篩選陽性克隆,抽提質(zhì)粒并送進(jìn)位置生物科技有限公司測序,使用LkO-5(GACTATCATATGCTTACCGT)通用引物測序。

        表1 ABCG1和ABCG4的sgRNA寡核苷酸序列

        注:黑色加粗字體表示在序列兩端添加的堿基。

        Note:The black bold font indicates the base added at both ends of the sequence.

        1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)和細(xì)胞轉(zhuǎn)染 提前將10 % FBS DMEM于水浴鍋中37 ℃水浴10 min左右,293T細(xì)胞用1 mL培養(yǎng)基重懸,加入10 cm培養(yǎng)皿中,補10 mL DMEM培養(yǎng)基于5 % CO2,37 ℃恒溫培養(yǎng)。細(xì)胞傳兩代后,進(jìn)行計數(shù),待細(xì)胞長到85 %以上進(jìn)行鋪板。細(xì)胞轉(zhuǎn)染前24 h,進(jìn)行計數(shù)按照一定比例鋪6孔板。選擇形態(tài)規(guī)則、融合度約在70 %~80 %的細(xì)胞,進(jìn)行PEI質(zhì)粒轉(zhuǎn)染。將待轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒(3000 ng)與PEI(2000 ng/mL)按3∶1的比例加入2 mL EP管,孵育5 min后,加入到NaCI和PEI的混合液中,混勻后靜置20 min,轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞于5 % CO2,37 ℃恒溫培養(yǎng)。重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染6 h后,用PBS或0.9 % NaCl清洗一次,培養(yǎng)基換成含10 % FBS培養(yǎng)細(xì)胞。轉(zhuǎn)染48 h后,觀察質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率,選取轉(zhuǎn)染效率高的且形態(tài)規(guī)則的細(xì)胞進(jìn)行加嘌呤霉素處理(終濃度20 μg/mL), 24~48 h后用0.9 % NaCl清洗換液,10 %FBS含雙抗培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)胞。

        1.2.4 靶位點編輯效率驗證 轉(zhuǎn)染72 h后提取細(xì)胞基因組DNA,通過PCR擴(kuò)增目的細(xì)胞基因組以得到目的DNA片段,回收PCR產(chǎn)物,采用T7E1核酸內(nèi)切酶酶切回收后的AsCpf1-ABCG1-sgRNA1、LbCpf1-ABCG1-sgRNA2、AsCpf1-ABCG4-sgRNA1和LbCpf1-ABCG4-sgRNA2 DNA條帶片段,使用3 %的瓊脂糖凝膠檢測DNA 片段,目的片段測序驗證sgRNA編輯效率。

        1.2.5 篩選穩(wěn)定細(xì)胞株 轉(zhuǎn)染96 h后,觀察細(xì)胞生長狀況并計數(shù),采用有限稀釋法按每孔5~6個細(xì)胞稀釋到96孔板中,培養(yǎng)5~7 d后,在顯微鏡下觀察96孔板中的細(xì)群落的個數(shù),并做好記錄。細(xì)胞生長到一定階段會發(fā)生細(xì)胞堆積,根據(jù)細(xì)胞生長情況選取“單細(xì)胞”的96孔,可消化后緩慢吹打孔中的細(xì)胞,使細(xì)胞密度均勻,有利于加速細(xì)胞增殖的速度。5~7 d后,選取其中狀態(tài)較好且已長滿的96孔的單細(xì)胞系,經(jīng)過消化后,取出一部分細(xì)胞液,剩余細(xì)胞液添加培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)。取出的細(xì)胞12 000 r/min 離心2 min,移去上清,PBS清洗1次,加入1×PCR稀釋液裂解細(xì)胞2 U,蛋白酶K消化產(chǎn)物中蛋白,95 ℃ 5 min后,取5~10 μl作為巢式PCR擴(kuò)增的模板。

        1.2.6 單克隆細(xì)胞系驗證 單克隆細(xì)胞基因組擴(kuò)增產(chǎn)物切膠純化后雙向測序。對測序結(jié)果進(jìn)行分析,選擇正確有編輯的結(jié)果分別將其對應(yīng)的PCR產(chǎn)物進(jìn)行TA克隆,每個選取30個陽性克隆送測序。觀察PCR產(chǎn)物TA克隆測序結(jié)果是否存在雙克隆,如果存在需將雙克隆菌液劃線培養(yǎng),挑斑并選取10個孔菌液送測,以進(jìn)一步確定是否為單克隆細(xì)胞。根據(jù)測序結(jié)果,選取移碼的突變細(xì)胞株轉(zhuǎn)入6孔細(xì)胞培養(yǎng)皿進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)后抽提基因組,再次進(jìn)行PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物純化測序,確定為只含兩種峰型的突變細(xì)胞株,將驗證后的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到10 cm細(xì)胞皿擴(kuò)大培養(yǎng),待細(xì)胞長滿后進(jìn)行凍存。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 重組質(zhì)粒的測序

        重組質(zhì)粒AsCpf1-ABCG1-sgRNA1、LbCpf1-ABCG1-sgRNA2、AsCpf1-ABCG4-sgRNA1和LbCpf1-ABCG4-sgRNA2的測序結(jié)果顯示,在靶位點插入的片段位置、方向及序列與預(yù)期結(jié)果一致,證明ABCG1和ABCG4的sgRNA插入到AsCpf1/LbCpf1載體中,重組質(zhì)粒構(gòu)建成功(圖2~5)。

        圖1 CRISPR/Cpf1-sgRNA載體圖譜Fig.1 CRISPR/Cpf1-sgRNA vector

        圖2 AsCpf1-ABCG1-sgRNA1靶位點測序結(jié)果Fig.2 Sequencing results of target sites of AsCpf1-ABCG1-sgRNA1

        圖3 LbCpf1-ABCG1-sgRNA2靶位點測序結(jié)果Fig.3 Sequencing results of LbCpf1-ABCG1-sgRNA2 target sites

        圖4 AsCpf1-ABCG4-sgRNA1靶位點測序結(jié)果Fig.4 Sequencing results of target sites of AsCpf1-ABCG4-sgRNA1

        圖5 LbCpf1-ABCG4-sgRNA2靶位點測序結(jié)果Fig.5 Sequencing results of LbCpf1-ABCG4-sgRNA2 target sites

        2.2 細(xì)胞培養(yǎng)和細(xì)胞轉(zhuǎn)染

        將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞,48 h后,熒光顯微鏡下觀察4組293T細(xì)胞都有綠色熒光蛋白表達(dá)(圖6),對比白光下的細(xì)胞對比明顯較少。

        2.3 sgRNA靶向敲除效率T7E1酶切驗證

        轉(zhuǎn)染72 h后提取細(xì)胞基因組DNA,通過PCR擴(kuò)增目的細(xì)胞基因組以得到目的DNA片段,AsCpf1-ABCG4-sgRNA 1細(xì)胞基因組沒有擴(kuò)增出來,其他3個靶位點均擴(kuò)增出了目的條帶,PCR產(chǎn)物經(jīng)過T7E1酶切后,通過反顯圖可以看出產(chǎn)生明顯的掉帶,AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1和LbCpf1-ABCG1-sgRNA 2掉帶大小均為667 bp,AsCpf1-ABCG4-sgRNA 1掉落2個分別為220和447 bp的條帶;LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2掉帶大小均為642 bp,LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2掉落2個分別為156和486 bp的條帶(圖7),表明3個sgRNA靶向敲除效率均較高。將T7E1酶切驗證有編輯效率的3個靶位點對應(yīng)的PCR產(chǎn)物測序進(jìn)一步驗證,表明AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1、LbCpf1-ABCG1-sgRNA 2和LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2測序產(chǎn)物完全正確且均靶位點處有明顯套峰,說明3個靶位點編輯成功。

        2.4 穩(wěn)定細(xì)胞株構(gòu)建

        將編輯后的細(xì)胞采用有限稀釋法每孔4~5個分到96孔培養(yǎng)皿中,篩選并標(biāo)記單克隆細(xì)胞(圖8),對篩選結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析,AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1一共篩出10個單克隆細(xì)胞,LbCpf1-ABCG1-sgRNA 2一共篩出17個單克隆細(xì)胞,LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2一共篩出8個單克隆細(xì)胞。

        A:AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1;B:LbCpf1-ABCG1-sgRNA 2;C:AsCpf1-ABCG4-sgRNA 1;D:AsCpf1-ABCG4-sgRNA 1圖6 293T細(xì)胞熒光蛋白表達(dá)Fig.6 Fluorescent protein expression in 293T cells

        Lane1:AsCpf1-1-g1產(chǎn)物+H2O;Lane2:AsCpf1-1-g1產(chǎn)物+T7E1酶;Lane3:LbCpf1-1-g2產(chǎn)物+H2O;Lane4:LbCpf1-1-g2產(chǎn)物+T7E1酶;Lane5:LbCpf1-4-g2產(chǎn)物+H2O;Lane6:LbCpf1-4-g2產(chǎn)物+7E1酶;LaneM:Marker DS5000圖7 sgRNA靶向敲除效率Fig.7 Targeted knockout efficiency of sgRNA

        A-單細(xì)胞在白光視野下(4×);B-單細(xì)胞在白光視野下(10×)A-single cell under white light (4×) and B-single cell under white light (10×)圖8 單克隆細(xì)胞Fig.8 Monoclonal cells

        2.5 單克隆細(xì)胞系編輯效率驗證

        單細(xì)胞系巢式PCR擴(kuò)增送測,測序結(jié)果表明AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1有編輯效率的有4個,LbCpf1-ABCG1-sgRNA 2有編輯效率的有3個,LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2有編輯效率的有1個。將有編輯效率的細(xì)胞基因組PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行TA克隆,挑取30個陽性克隆測序驗證,其中5個單細(xì)胞系均在兩套峰型以上,確定為雙克隆細(xì)胞株,只有3個具有一套或兩套峰型:

        AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1-1為單一的兩套峰型,一套缺失7個堿基GACCTGC,一套缺失34個堿基ACATGGAGGCCACTGAGACGGACCTGCTGAATGG(圖9),是純合的單克隆細(xì)胞株;AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1-2不是單一的兩套峰型,一套缺失21個堿基GAGGCCACTGAGACGGACCTG,一套缺失25個堿基TGAGACCTGCTGAATGGACATCTGA(圖10),有雙克隆需進(jìn)一步策序驗證;LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2-1僅為單一的一套峰型,缺失1個G堿基,突變7個堿基CGGCAGG(圖11),是一個純合的單克隆細(xì)胞株。

        圖9 AsCpf1-ABCG1-g1-1 TA克隆測序結(jié)果Fig.9 Cloning and sequencing results of AsCpf1-ABCG1-g1-1TA

        圖10 AsCpf1-ABCG1-g1-2 TA克隆測序結(jié)果Fig.10 Cloning and sequencing results of AsCpf1-ABCG1-g1-2TA

        2.6 雙克隆細(xì)胞系編輯效率驗證

        將AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1-2測序菌液XM504劃線培養(yǎng),選取10個孔菌液送測,分析其測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)除了有兩套目的峰型外,還有3個雙克隆(圖12)。通過對其峰型進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),雙克隆的套峰是由GGCCACACGG和GGACATCTGA兩種峰型雜合形成的,與兩套目的峰型的結(jié)果一致,確定為雙克隆細(xì)胞株。

        2.7 單克隆細(xì)胞株測序作最終效率驗證

        根據(jù)TA克隆測序結(jié)果,選取移碼的突變細(xì)胞株轉(zhuǎn)入6孔細(xì)胞培養(yǎng)皿進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)后抽提基因組,再次進(jìn)行PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物純化并測序,通過分析比對靶位點附近的堿基序列及峰型,AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1-1在靶位點處的套峰是由TGTCCAGCA和CGTGAATGG兩種峰型雜合形成的,與TA克隆測序的結(jié)果一致,是一個純合的單克隆細(xì)胞株(圖13);AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1-2在靶位點處的套峰是由GGCCACACGG和GGACATCTGA兩種峰型雜合形成的,與TA克隆測序的結(jié)果一致,為只含兩種突變類型的突變細(xì)胞株(圖14),結(jié)合TA克隆和終驗證測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)靶位點后面有單個堿基的隨機(jī)突變,不是穩(wěn)定的單克隆細(xì)胞;LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2-1靶位點處僅為1個堿基缺失,7個堿基突變(CGGCAGG)的單一峰型,是一個純合的單克隆細(xì)胞株(圖15)。

        圖11 AsCpf1-ABCG4-g2-1 TA克隆測序結(jié)果Fig.11 Cloning and sequencing results of AsCpf1-ABCG4-g2-1TA

        圖12 AsCpf1-ABCG1-g1-2 雙克隆測序驗證Fig.12 Verification of AsCpf1-ABCG1-g1-2 biclonal sequencing

        圖13 AsCpf1-ABCG1-g1-1終驗證Fig.13 Verification of AsCpf1-ABCG1-g1-1

        圖14 AsCpf1-ABCG1-g1-2終驗證Fig.14 Verification of AsCpf1-ABCG1-g1-2

        圖15 AsCpf1-ABCG4-g2-1終驗證Fig.15 Verification of AsCpf1-ABCG4-g2-1

        3 討 論

        2012年,Jinek等證實了Cas9 可以在體外條件下與DNA 靶序列的特定位點結(jié)合并進(jìn)行剪切,由此揭開了將CRISPR/Cas9 改造為基因編輯工具的序幕。近5 年來,CRISPR/Cas9技術(shù)為生物領(lǐng)域帶來了巨大的沖擊,2013 年被Science 雜志評為十大科學(xué)突破之一,2015 年更是榮登榜首。然而,隨著研究的不斷深入,CRISPR/Cas9暴露了它的缺陷和局限性,例如嚴(yán)重的脫靶效應(yīng)。如何改造CRISPR/Cas9,降低其脫靶效應(yīng),提高基因編輯精確度,是目前科學(xué)家們關(guān)注和研究的重點[5]。

        CRISPR/Cpf1 是繼CRISPR/Cas9后,2015 年報道的一種新型CRISPR 效應(yīng)蛋白,利用人工設(shè)計的sgRNA介導(dǎo)外源表達(dá)的Cpf1蛋白與基因組靶點特異性結(jié)合以實現(xiàn)對基因組DNA 的特異性切割,切割后的基因組DNA通過非同源末端連接(NHEJ)或同源重組(HDR)的方式進(jìn)行修復(fù),NHEJ是真核細(xì)胞中斷裂DNA主要的修復(fù)方式,在修復(fù)的過程中會在斷裂DNA鏈中隨機(jī)的插入或缺失不定數(shù)目的堿基,通過基因移碼突變來實現(xiàn)目的基因功能的缺失。CRISPR/Cpf1有利于克服CRISPR/Cas9 應(yīng)用中的一些限制,作為新一代的CRISPR 基因組編輯工具,對CRISPR/Cpf1的研究才剛剛開始,有許多發(fā)展、改造和利用的空間[10]。

        本研究一方面通過摸索條件,建立成熟的CRISPR/Cpf1基因敲除系統(tǒng),為同類或其他基因的敲除提供借鑒。為了保證此次實驗篩選的細(xì)胞為有編輯的單克隆細(xì)胞,在篩選的前期過程中,加入了嘌呤霉素大量殺死沒有轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞以提高細(xì)胞的編輯效率,在篩選后期過程中,對TA克隆測序中可能存在的雙克隆細(xì)胞,進(jìn)行雙克隆菌液劃線培養(yǎng)后進(jìn)一步測序驗證;另一方面,繼CRISPR/Cpf1出現(xiàn)兩年以來,各國研究組先后利用CRISPR/Cpf1 完成了對少數(shù)微生物、植物和動物基因組的編輯,目前還尚未有ABCG1/ABCG4基因采用CRISPR/Cpf1技術(shù)敲除的研究報道,ABCG1和ABCG4基因能夠直接或間接的調(diào)控細(xì)胞中膽固醇代謝,深入研究其在膽固醇代謝中具體調(diào)節(jié)作用,將有助于了解一系列固醇類疾病的發(fā)病機(jī)制,并為此類疾病的防治提供新的方向與方法。本研究構(gòu)建的目的細(xì)胞ABCG1/ABCG4基因敲除的細(xì)胞系,是深入研究ABCG1和ABCG4基因功能的前提基礎(chǔ)。

        4 結(jié) 論

        本研究通過利用新型基因編輯技術(shù)CRISPR/Cpf1系統(tǒng),利用人工設(shè)計的sgRNA介導(dǎo)外源表達(dá)的Cpf1蛋白與基因組靶點ABCG1和ABCG4特異性結(jié)合,通過基因移碼突變來實現(xiàn)目的基因功能的缺失,永久性敲除了目的細(xì)胞靶基因,獲得敲除ABCG1和ABCG4基因的穩(wěn)定細(xì)胞株各1株(AsCpf1-ABCG1-sgRNA 1-1和LbCpf1-ABCG4-sgRNA 2-1)。穩(wěn)定的基因敲除細(xì)胞株可直接用于后續(xù)研究,為進(jìn)一步探索和證實ABCG1和ABCG4在細(xì)胞中膽固醇代謝和調(diào)節(jié)作用提供幫助,加快相關(guān)的醫(yī)學(xué)臨床應(yīng)用研究的進(jìn)展,同時建立了成熟的CRISPR/Cpf1基因敲除系統(tǒng),可為同類或其他基因的敲除提供借鑒。

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