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        基于磁共振指紋成像技術(shù)的腦部成像

        2019-05-13 09:54:34張璐堅(jiān)
        科技視界 2019年8期
        關(guān)鍵詞:字典大腦

        張璐堅(jiān)

        【摘 要】為了解決傳統(tǒng)磁共振成像技術(shù)一次掃描只能得到一種加權(quán)像,且成像時(shí)間過(guò)長(zhǎng),掃描過(guò)程產(chǎn)生噪聲等問(wèn)題,提出了“磁共振指紋”成像方法。人腦有多種組織組成,每種組織的磁共振掃描都有自己不同特征信號(hào)該信號(hào)被稱(chēng)為“指紋”?!按殴舱裰讣y”成像方法一次掃描不僅可同時(shí)得到 T1圖,T2圖 及 質(zhì)子密度圖像;而且大大縮短了掃描時(shí)間。該新技術(shù)在成像算法上也與傳統(tǒng)磁共振算法完全不同。基于字典的匹配方法,首先建立指紋“字典”;之后將每個(gè)體素的檢測(cè)信號(hào)與“字典”中的所有信號(hào)進(jìn)行逐條匹配;然后確定是該信號(hào)的參數(shù)組合;最終得到多種參數(shù)的參數(shù)圖像。本實(shí)驗(yàn)采用大腦數(shù)據(jù)進(jìn)行模擬采集和匹配過(guò)程。結(jié)果表明,該方法可以得到各種組織參數(shù)圖像,且確實(shí)會(huì)大大降低磁共振掃描所需的時(shí)間。

        【關(guān)鍵詞】磁共振指紋;字典;參數(shù)圖像;大腦

        中圖分類(lèi)號(hào): R318 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: A 文章編號(hào): 2095-2457(2019)08-0001-003

        DOI:10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2019.08.001

        【Abstract】There are some defects in the traditional magnetic resonance imaging methods. For example, only one weighted image can be obtained in one scan, and the scanning time is too long and the scanning process produces noise. Therefore, the "magnetic resonance fingerprint" imaging method was proposed. The human brain is made up of a variety of tissues, each tissue has its own characteristic signal during MR scans that is called a" fingerprinting". MRf imaging method can obtain T1 map, T2 map and proton density map at the same time. It also shortens the scanning time. The new technique is also different from the traditional magnetic resonance algorithm. Firstly, a fingerprint "dictionary" is established based on the dictionary matching method. Then the detection signal of each individual element is matched with all signals in the "dictionary" one by one. Then the parameter combination of the signal is determined. Finally, the parametric images of various parameters are obtained. This experiment uses brain data to simulate collection and matching process. The results show that this method can obtain various tissue parameter images and reduce the time required for MR scanning.

        【Key words】Magnetic resonance fingerprinting; Dictionary; Parameter map; Brain

        0 引言

        核磁共振成像技術(shù)(Magnetic Resonance Imaging, MRI)近些年在臨床上作為重要的臨床診斷方法之一被廣泛使用[1],但是核磁共振成像技術(shù)仍需要解決較多問(wèn)題。問(wèn)題之一就是核磁共振成像是定性的檢測(cè)技術(shù)。它能通過(guò)不同物質(zhì)表現(xiàn)的信號(hào)強(qiáng)度不同,成像時(shí)通過(guò)相對(duì)亮度的不同,雖然能夠準(zhǔn)確檢測(cè)出每種組織的特性, 但它產(chǎn)生的信號(hào)受到許多其它外部條件的影響比如掃描的類(lèi)型,探測(cè)器等,而且對(duì)組織內(nèi)部信號(hào)強(qiáng)度不同的區(qū)域不敏感。問(wèn)題二就是它進(jìn)行多參數(shù)加權(quán)成像,如T1加權(quán)圖T2加權(quán)圖等[2],對(duì)于圖像的灰度信息卻不能給出其生理特質(zhì)。在臨床上,這就需要診斷醫(yī)生具有較高的經(jīng)驗(yàn)。問(wèn)題三是MRI成像時(shí)間長(zhǎng),掃描速度慢在檢測(cè)時(shí)還會(huì)伴有令人不愉悅的噪聲,給病人造成一定的心理壓力。

        2013年,Dan Ma, Vikas Gulani, Nicole Seiberlich和Mark A.Griswold等人提出了“磁共振指紋”成像技術(shù)(Magnetic Resonance Fingerprinting, MRf)[3]。利用"磁共振指紋"成像技術(shù)產(chǎn)生的不再是加權(quán)圖像而是參數(shù)量化圖。而且在一次采集中能同時(shí)檢測(cè)出多種參數(shù)的量化圖,簡(jiǎn)化采集的過(guò)程[4]。并且,利用這種新的采集和成像技術(shù),我們可以大大的縮短采集信息所需要的時(shí)間。而且使用這種新方法可以減少掃描時(shí)產(chǎn)生的噪音,甚至可以用音樂(lè)編碼,使人在檢測(cè)時(shí)有愉悅的體驗(yàn)[5]。并且,由于MRf技術(shù)時(shí)定量成像技術(shù),可以對(duì)腫瘤早期診斷,分級(jí)等方面都有很好的表現(xiàn)[6]。

        伴隨著這種新技術(shù)的產(chǎn)生,相比于傳統(tǒng)的磁共振成像,磁共振指紋成像方法采用嶄新的數(shù)據(jù)采集方式,數(shù)據(jù)處理方式和數(shù)據(jù)重建方式,也產(chǎn)生了多種對(duì)"磁共振指紋"成像算法的新研究[7]。

        利用組織參數(shù)偽隨機(jī)的采集方式,使用磁共振技術(shù)來(lái)捕獲人體各不同組織唯一獨(dú)有的信號(hào),該信號(hào)即被稱(chēng)為指紋。然后需要將采集信號(hào)利用模式識(shí)別算法與已建立的指紋字典數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行匹配,在字典中找到該信號(hào)相應(yīng)的參數(shù)組成,最終把磁共振參數(shù)轉(zhuǎn)變?yōu)榱炕瘓D譜。

        1 方法與過(guò)程

        字典的建立通常需要多種參數(shù),如T1,T2,翻轉(zhuǎn)角,時(shí)間周期以及偏振頻率等。為了提高時(shí)間效率,我們簡(jiǎn)化字典建立過(guò)程,本文使用T1,T2,翻轉(zhuǎn)角以及重復(fù)時(shí)間(TR)來(lái)創(chuàng)建字典。

        首先確定字典大小和精度。選定T1值和T2值,再配合翻轉(zhuǎn)角和重復(fù)時(shí)間進(jìn)入布洛赫方程運(yùn)算就得到了我們的字典的信號(hào)曲線(xiàn)。所以,不同的T1,T2組合在相同的磁共振環(huán)境中產(chǎn)生不一樣的信號(hào)曲線(xiàn),確定了T1,T2的組合方式就決定了本文字典的大小。字典中T1、T2細(xì)分的組合越多,精度就越高,相應(yīng)的造成字典較大,匹配所需時(shí)間較長(zhǎng)等問(wèn)題。

        本文使用大腦模型,所以根據(jù)大腦組織的生理特性,我們將T1、T2不均勻劃分。T1值的范圍為100~5000ms,我們將T1劃分為兩部分,10ms~2000ms的部分以20ms的梯度增加,大于2000ms的部分以100ms的梯度增加; T2值的范圍為20~3000ms,T2被劃分為三部分,小于100ms的部分以2ms的梯度增加, 大于100ms且小于200ms的部分以5ms的梯度增加, 大于200ms的部分以200ms的梯度增加。得到T1,T2參數(shù)的排列組合數(shù),但由于磁共振信號(hào)的特征,現(xiàn)實(shí)T1

        與MRI相比MRf是利用在同一個(gè)K空間編碼時(shí),采用偽隨機(jī)產(chǎn)生的變化的RF翻轉(zhuǎn)角和TR值。所以,我們需要間里偽隨機(jī)變化的翻轉(zhuǎn)角(FA)和重復(fù)時(shí)間(TR)。本文的TR取值范圍為9~14ms。用短TR保證MRf序列總時(shí)間相比MRI更短。本文的翻轉(zhuǎn)角(FA)取值范圍為0~60度之間。

        將參數(shù)T1、T2、TR以及FA組合放入布洛赫方程計(jì)算[8],得到我們的字典信號(hào)曲線(xiàn)。

        其中,mr為旋轉(zhuǎn)矩陣,α為翻轉(zhuǎn)角;φ為射頻脈沖的相位角;M0為初始值。最終得到字典信號(hào)。

        模擬數(shù)據(jù)采集,利用BrainWeb數(shù)據(jù)庫(kù)提供的人腦數(shù)據(jù)模型,選擇正常人腦10層數(shù)據(jù)作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象。并將BrainWeb的數(shù)據(jù)擴(kuò)充為256*256大小。人體大腦模型由10種不同組織組合而成[9], 各種組織的T1, T2以及質(zhì)子密度信息見(jiàn)表1。

        對(duì)模型采用500組不同的FA和TR構(gòu)成的序列參數(shù), 模擬進(jìn)行螺旋的k空間軌跡采樣, 并采用快速非均勻傅里葉重建算法NUFFT[10], 得到500組重建圖像。取出空間中每個(gè)體素點(diǎn)在500組圖像中的信號(hào)進(jìn)行組合, 形成每個(gè)體素點(diǎn)的信號(hào)曲線(xiàn)。該曲線(xiàn)代表的該組織隨時(shí)間衰減的信號(hào), 以備后續(xù)與字典匹配時(shí)使用。

        將通過(guò)模擬采樣得到的每個(gè)體素點(diǎn)的信號(hào)曲線(xiàn)與之前生成的字典庫(kù)進(jìn)行模式匹配,最終確定該體素點(diǎn)的T1、T2的組成信息。最終可得到定量的T1圖、T2圖等等。

        2 結(jié)果

        我們采用配置為Intel (R) Core (TM) i5-8300H處理器, 2.3 GHZ, 8 G內(nèi)存和2 T硬盤(pán)的聯(lián)想個(gè)人筆記本, 在MATLAB2017b環(huán)境下進(jìn)行測(cè)試。

        我們采用均方根誤差來(lái)作為衡量算法性能的標(biāo)準(zhǔn)。用模擬采集重建數(shù)據(jù)的匹配參數(shù)圖與原始圖之間作均方根誤差比較,誤差越小, 匹配準(zhǔn)確度越高。該公式為:

        其中,X代表匹配后的參數(shù)結(jié)果圖數(shù)據(jù),Y代表原始圖像數(shù)據(jù)。

        根據(jù)誤差計(jì)算公式,得到誤差結(jié)果,如表2所示。

        每一次的匹配時(shí)間都在6000s左右。由圖和表2可知,通過(guò)字典匹配可以得到定量的磁共振指紋T1圖以及T2圖,但是匹配所需時(shí)間較長(zhǎng)。

        圖3展示了在第68、72、100、120層的T1/T2原始參數(shù)圖和字典匹配方法得到的T1/T2參數(shù)圖。3a列為各層原始T1圖;3b列為各層原始T2圖;3c列為各層匹配后得到的T1圖;3d列為各層匹配后得到的T2圖。

        如果,我們?cè)谧值渲屑尤肫渌畔?,還可以通過(guò)一次MRf掃描匹配得到更多的信息。

        3 總結(jié)

        采用“磁共振指紋”技術(shù)可以大大加快采集速度,減少病人的采集時(shí)間降低病人的心理負(fù)擔(dān),這樣也可以使得磁共振檢測(cè)在兒童等不容易控制的人群身上使用。而且,由于“磁共振指紋”技術(shù)是定量檢測(cè),所以在早期預(yù)防診療中,也可以發(fā)揮作用。但是,在“磁共振指紋”成像技術(shù)上,還有許多的難點(diǎn)存在。例如,如何加快成像時(shí)間,提高圖片質(zhì)量;以及字典的壓縮,降低存儲(chǔ)空間等等都是值得進(jìn)一步深入探究的方面。

        “磁共振指紋”技術(shù)給磁共振檢測(cè)提出了新的方案,相信在將來(lái),可以利用"磁共振指紋"技術(shù)給更多的人提供高效的檢測(cè)方案。

        【參考文獻(xiàn)】

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