張杰,熊文,張映,王嬌,楊洪一*,王濱松
(1.東北林業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,黑龍江 哈爾濱150040;2.黑龍江大學(xué)化學(xué)化工與材料學(xué)院,黑龍江 哈爾濱150080)
納米銀具有催化、抗菌、非線性光學(xué)及導(dǎo)熱、導(dǎo)電等特性,在無(wú)機(jī)催化材料、抗菌劑、導(dǎo)電漿料等領(lǐng)域有著廣闊的應(yīng)用前景[1–4]。目前,納米銀制備多采用物理和化學(xué)方法,尋找簡(jiǎn)單環(huán)保的適合大規(guī)模制備的均一性好、穩(wěn)定性好的納米銀制備方法,仍然是廣大納米材料研究者面臨的富有挑戰(zhàn)性的課題。相對(duì)于化學(xué)方法,生物方法合成具有條件溫和、操作簡(jiǎn)單、環(huán)境友好等特點(diǎn)。藻類[5]、細(xì)菌[6–8]、真菌[9–11]等許多微生物與硝酸銀作用都能制備納米銀粒子。細(xì)菌生長(zhǎng)繁殖快,生長(zhǎng)周期短,可大規(guī)模制備納米銀,是一種極具潛力的微生物材料。目前,關(guān)于制備納米銀優(yōu)良菌株篩選的報(bào)道較少。筆者擬篩選出納米銀高產(chǎn)率化制備的優(yōu)良菌株,現(xiàn)將研究結(jié)果報(bào)道如下。
于東北林業(yè)大學(xué)林場(chǎng)取土壤樣品,共設(shè)6個(gè)樣點(diǎn),于距地面深20 cm處取樣。將樣品混合后組成代表樣,裝入無(wú)菌封口塑料袋內(nèi),于4℃冰箱保存,備用。
Luria–Bertani(LB)培養(yǎng)基的制備:將胰蛋白胨10g、酵母提取物 5g、NaCl 10g 混合,加蒸餾水定容至1 000mL,pH 調(diào)至7.4。
改良Luria–Bertani(LB)培養(yǎng)基(不加NaCl,防止生成氯化銀沉淀)的制備:將胰蛋白胨 10g 和酵母提取物 5g 混合,加蒸餾水定容至1 000mL,調(diào)pH 至7.4。
主要儀器:HZQ–F160A 型高低溫恒溫振蕩培養(yǎng)箱(上海一恒科技有限公司);GeneAmp9700 型PCR 擴(kuò)增儀(美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)中國(guó)公司);himacCF16RX 型高速冷凍離心機(jī)(日本HITACHI 公司);TECNAI G2 型透射電子顯微鏡(荷蘭Philips– FEI 公司);Bruker D8 型X–射線衍射儀(德國(guó)Bruker 公司);熱重分析儀(TGA/ DSC2)。
主要試劑:DNA 提取試劑盒和凝膠回收試劑盒(北京莊盟國(guó)際生物基因科技有限公司);E.coli JM109 感受態(tài)細(xì)胞(BioDev 公司);pMD18–T Vector、PCR 反應(yīng)用的試劑(大連TaKaRa 公司);Tryptone、Yeast Extract 和NaCl(Oxied 公司);細(xì)菌微量生化反應(yīng)管(杭州天和微生物試劑有限公司);氨芐青霉素(哈爾濱制藥總廠);其他常規(guī)試劑均為分析純。
稱取土壤樣品5g,加入到裝有5mL 蒸餾水的三角瓶中,制成土壤懸浮液。取1mL 懸浮液接種于改良的LB 液體培養(yǎng)基中,150 r/min 振蕩,富集培養(yǎng)18 h 后,向富集培養(yǎng)液中加入硝酸銀溶液,使硝酸銀終濃度為0.1 mmol/L,避光馴化48 h,分別逐級(jí)提高硝酸銀的濃度至0.2、0.3、0.5、0.7、1.0 mmol/L。進(jìn)行多次富集與馴化后,取1.0 mmol/L的菌液,在LB 固體培養(yǎng)基上進(jìn)行濃度梯度稀釋劃線分離,得到能在含1 mmol/L 硝酸銀的改良LB 培養(yǎng)基上存活的菌株,于4℃冰箱中保存,備用。
1.5.1 常規(guī)鑒定
用透射電子顯微鏡觀察所獲得菌株的形態(tài)和大小,進(jìn)行革蘭氏染色、芽孢染色和鞭毛染色[12]。采用細(xì)菌微量生化反應(yīng)管對(duì)細(xì)菌的伏普(V–P)反應(yīng)、硝酸鹽培養(yǎng)基生長(zhǎng)、糖發(fā)酵產(chǎn)酸、淀粉水解、明膠液化、檸檬酸鹽利用、硝酸鹽還原和酪素分解[13–18]等生理生化試驗(yàn)進(jìn)行鑒定。
1.5.2 16SrDNA 序列分析
菌株基因組采用細(xì)菌DNA 提取試劑盒提取,以細(xì)菌總DNA 為模板,利用細(xì)菌通用引物(27 F(5'–AGAGTTTGATCCTGGCTCAG–3')和1492 R (5'–GGTTACCTGTTACGT–3')進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。
PCR 反應(yīng)體系:將10×PCR Buffer 5 μL、10 mmol/L 的dNTPs 1 μL、2.5 μmol/L 的上游和下游引物各4 μL、5 U/μLTaq 酶0.5 μL,DNA1 μL 模板混合,加去離子水至總體積50 μL。
PCR 反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3min;94℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸2min,30個(gè)循環(huán);72℃保溫10min。4℃保存。
用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的大小和特異性。PCR 產(chǎn)物純化后,用膠回收試劑盒回收目的片段,并與PMD18–T 連接,轉(zhuǎn)化E.coli JM109,然后在含有氨芐霉素(AMP)的培養(yǎng)基中挑取白色單菌落(陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。將陽(yáng)性克隆子送至上海生物工程公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序所獲序列信息提交GenBank 核酸數(shù)據(jù)庫(kù),用BLAST 程序進(jìn)行比對(duì),搜索同源性較高的相關(guān)序列,采用MEGA5.2軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。進(jìn)化樹(shù)分支穩(wěn)定性用 Bootstrap 分析,重復(fù)1 000次。
刮取固體平板菌種一環(huán),接入LB 液體培養(yǎng)基中,于37℃恒溫?fù)u床上150 r/min 培養(yǎng)18 h,進(jìn)行菌種活化。取5mL 活化好的菌株接入300mL 改良的LB 液體培養(yǎng)基中,于37℃恒溫?fù)u床150 r/min 振蕩培養(yǎng)24 h。取198mL 細(xì)菌培養(yǎng)液,加入2mL 0.1 mol/L 的AgNO3溶液,使其Ag+終濃度為1 mmol/L,避光培養(yǎng)3 d。將培養(yǎng)液于14 000 r/min 離心10min,用蒸餾水洗沉淀3次,自然風(fēng)干,得到納米銀顆粒。納米銀顆粒用X–射線衍射儀(XRD)進(jìn)行表征,工作電壓40 kV,掃描速度為10o/min;利用透射電子顯微鏡(TEM)在80 kV 電壓下觀察納米銀的形貌及納米銀的大??;采用熱重分析儀(TGA)對(duì)離心得到的納米銀顆粒沉淀物進(jìn)行分析。
通過(guò)逐級(jí)提高硝酸銀的濃度,富集和馴化,篩選出了1 株能在含1 mmol/L 硝酸銀改良液體LB 培養(yǎng)基中存活的菌株,將其命名為zxw01。加入AgNO3避光培養(yǎng)后,圖1–c 中菌株的顏色由土黃色變?yōu)榧t棕色,而圖1–a 和圖1–b 中菌株的顏色無(wú)變化。這種明顯的顏色變化與金屬粒子的表面等離子體共振效應(yīng)(SPR 效應(yīng))有關(guān),據(jù)此,可初步判定菌株zxw01 有合成納米銀的能力。
圖1 添加硝酸銀前后菌株zxw01 的顏色變化 Fig.1 Color change of the zxw01 bacteria before and after AgNO3 added
2.2.1 菌落的形態(tài)及其生理、生化特征
由圖2 可以看出,菌體呈桿狀,大小為(1.23~1.78) μm ×(0.36~0.85) μm。
圖2 菌株zxw01 的電鏡照片 Fig.2 TEM image of zxw01
菌株zxw01 在LB 固體培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的菌落為圓形,表面光滑,邊緣整齊,呈黃色,細(xì)菌革蘭氏染色為陽(yáng)性,芽孢染色可見(jiàn)卵圓形芽孢,孢囊膨大,中生或近中生,鞭毛染色可觀察到菌株的鞭毛,光學(xué)顯微鏡暗視野中可觀察到該細(xì)菌能運(yùn)動(dòng)。
從表1 可知,該菌株不能利用D–木糖、乳糖、L–阿拉伯糖、蜜二糖、山醇、甘糖、肌醇、甘露醇、鼠李糖、山梨醇和乳糖,可以利用檸檬酸、葡萄糖、果糖、尿素、馬尿酸、麥芽糖和蔗糖,明膠液化、淀粉水解、過(guò)氧化氫酶、伏普(V–P )和硝酸鹽還原試驗(yàn)結(jié)果均呈陽(yáng)性,苯丙氨酸脫氨酶試驗(yàn)結(jié)果呈陰性。參照《伯杰細(xì)菌手冊(cè)》和《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》,可初步鑒定該菌為解淀粉酶芽孢桿菌。
表1 菌株zxw01 的生理生化試驗(yàn)結(jié)果 Table 1 Physiological and biochemical characteristics of strain zxw01
2.2.2 zxw01 的分子生物學(xué)鑒定結(jié)果
以菌株基因組DNA 為模板,以細(xì)菌16 SrDNA的通用引物進(jìn)行RCR 擴(kuò)增,對(duì)菌株的16 SrDNA 進(jìn)行測(cè)序,得到1 514 bp 序列。將測(cè)序結(jié)果提交到GenBank,登錄號(hào)為KF 700242。用BLAST 程序?qū)@得的16 SrDNA 序列與GenBank 中的所有序列進(jìn)行核苷酸同源性對(duì)比,采用MEGA5.2 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),用自展法(Bootstrap)檢驗(yàn)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的可靠性,自展1 000次得到菌株zxw01 的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖3)。由圖3 可見(jiàn),菌株zxw01 與解淀粉酶芽孢桿菌屬形成一個(gè)族群,且同源性達(dá)99%以上。結(jié)合形態(tài)學(xué)、生理生化特征以及16 SrDNA 分析,最終將zxw01 鑒定為芽孢桿菌屬的解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens )。
圖3 基于16SrDNA 序列同源性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) Fig.3 Phylogenetic tree of the bacteria strain based on 16 SrDNA sequenceshomology
由圖4 可以看出,在2θ 斜角為38.23°、44.56°、64.87°和77.48°處出現(xiàn)了明顯的特征性衍射峰,與JCPDS 卡 04–0783 上的數(shù)據(jù)(2θ 為 38.096°、44.257°、64.406°和77.452°)吻合,分別對(duì)應(yīng)于立方晶系銀的(111)、(200)、(220)和(311),說(shuō)明該細(xì)菌在添加硝酸銀后合成了面心立方結(jié)構(gòu)的納米銀顆粒,并且納米銀是無(wú)雜質(zhì)的。
圖4 利用zxw01 培養(yǎng)液合成的納米銀XRD 衍射圖譜 Fig.4 XRD pattern of AgNPs synthesized by the bacteria strain of zxw01
由圖5 可清楚地觀察到銀納米粒子的形態(tài)和粒徑大小,大部分為球形或近球形,粒徑大小為2~18 nm,平均粒徑為12.6 nm,粒徑分布窄且較均勻,具有較好的分散性,幾乎沒(méi)有團(tuán)聚現(xiàn)象。
圖5 zxw01 培養(yǎng)液合成納米銀的TEM 圖譜 Fig.5 TEM image of AgNPs synthesized by the bacteria strain of zxw01
Ag+終濃度為1 mmol/L 的培養(yǎng)液200mL 制備納米銀,最終離心后可獲得0.03g 的納米銀顆粒沉淀物。對(duì)沉淀物進(jìn)行熱重分析的結(jié)果(圖6)表明,隨著加熱溫度的升高,納米銀顆粒的質(zhì)量逐漸減少,當(dāng)溫度上升到580℃時(shí)達(dá)到熱穩(wěn)定狀態(tài),不再有質(zhì)量損失。其原因在于離心后得到的納米銀顆粒沉淀中含有的水和有機(jī)物,這些水和有機(jī)物在加熱過(guò)程中不斷釋放,最后達(dá)到穩(wěn)定。熱穩(wěn)定狀態(tài)時(shí)得到的納米銀質(zhì)量為納米銀顆粒沉淀物質(zhì)量的58%,由此可知,納米銀的實(shí)際產(chǎn)量為0.017 4g(0.03×58%),又知納米銀的理論產(chǎn)量為0.021 6g(0.2 (L)×1×10-3(mol/L)×108(g/mol)),因此,納米銀產(chǎn)率為80.6%(實(shí)際產(chǎn)量/理論產(chǎn)量)。
圖6 納米銀的熱重分析 Fig.6 Thermogravimetric analysis of silver nanoparticles
逐漸加大硝酸銀濃度進(jìn)行富集與馴化,篩選得到1 株能還原制備納米銀的菌株zxw01。該菌株能在含1 mmol/L 硝酸銀的改良LB 液體培養(yǎng)基中存活,并且能使得添加硝酸銀的菌株培養(yǎng)液由土黃色變?yōu)樽丶t色,合成的納米銀是分散的,呈球形或近球形,粒徑為2~18 nm,納米銀產(chǎn)率為80.6%。經(jīng)個(gè)體形態(tài)特征鑒定、生理生化特征鑒定和16 SrDNA 序列分析,將該菌鑒定為解淀粉酶芽孢桿菌(Bacillus amyqueciens)。
目前,在同類研究中,用細(xì)菌制備納米銀比用真菌更具優(yōu)勢(shì)。細(xì)菌繁殖快,生長(zhǎng)周期短,且關(guān)于細(xì)菌的發(fā)酵和遺傳改造經(jīng)驗(yàn)比關(guān)于真菌的更為豐富,這有利于基因工程操作,可以利用基因工程技術(shù),使特定的具有還原作用的酶以及起穩(wěn)定作用的蛋白大量表達(dá),從而實(shí)現(xiàn)納米粒子的大規(guī)模制備,所以,細(xì)菌在納米銀合成領(lǐng)域具有發(fā)展?jié)摿?,有待進(jìn)一步研究。
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湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)2015年4期