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        抗氧化烏拉爾甘草內(nèi)生菌株的篩選及鑒定

        2014-08-24 07:48:16,,,,
        關(guān)鍵詞:烏拉爾內(nèi)生發(fā)酵液

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        (1.浙江工業(yè)大學(xué) 藥學(xué)院,浙江 杭州 310032;2.浙江大學(xué) 生物系統(tǒng)工程與食品科學(xué)學(xué)院,浙江 杭州 310058)

        烏拉爾甘草(Glycyrrhizauralensis)為豆科多年生草本植物,主要分布在干旱、半干旱地區(qū),主產(chǎn)區(qū)在內(nèi)蒙古、寧夏及甘肅,是一種重要的藥用植物資源,有“十方九草”之稱[1-2].主要含有甘草酸、甘草次酸、黃酮、生物堿、氨基酸等成分,具有抗炎、抗病毒、抗腫瘤、抗菌等多種生理活性[3-4].

        近年來,植物內(nèi)生菌特別是藥用植物內(nèi)生菌,作為一種新的資源引起了人們的廣泛關(guān)注,已從中分離出了多種具有抗菌、抗腫瘤、殺蟲、免疫抑制和抗氧化等作用的生物活性物質(zhì),其中很多是具有特殊生物活性的新結(jié)構(gòu)物質(zhì)[5].王鴻等[6]從魚腥草內(nèi)生菌揮發(fā)性成分中分離到宿主活性成分的結(jié)構(gòu)類似物,表明內(nèi)生菌能產(chǎn)生與宿主具類似生理活性的物質(zhì).當(dāng)前對烏拉爾甘草內(nèi)生真菌的研究報(bào)道較少,主要對甘草中具有抗菌活性的菌株進(jìn)行了篩選,而內(nèi)生菌的抗氧化活性篩選則未見報(bào)道.本研究旨在分離鑒定內(nèi)蒙古地區(qū)烏拉爾甘草根、莖、葉中的內(nèi)生真菌,檢測其發(fā)酵產(chǎn)物的抗氧化活性,為探明內(nèi)蒙古烏拉爾甘草的道地性以及更好地開發(fā)利用甘草及內(nèi)生菌提供參考.

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        烏拉爾甘草植株采自內(nèi)蒙古呼和浩特.

        1.2 培養(yǎng)基

        馬鈴薯葡萄糖培養(yǎng)基(PDA培養(yǎng)基):固體培養(yǎng)基用于內(nèi)生真菌的分離純化,液體用于發(fā)酵.稱取馬鈴薯約200 g,洗凈后去皮切成小塊,煮沸30 min,紗布過濾后再加15 g葡萄糖和18 g瓊脂,溶化后補(bǔ)足水分至l 000 mL,pH自然,分裝至錐形瓶后12l ℃滅菌20 min.

        1.3 內(nèi)生真菌的分離與純化

        分別取新鮮甘草的根、莖、葉,分別用自來水沖洗干凈,濾紙吸干水分.按下列程序進(jìn)行表面消毒處理:先用體積分?jǐn)?shù)75%酒精浸泡1 min,無菌水沖洗3遍,再用0.1%的升汞處理30 s,無菌水沖洗4次.其次在無菌條件下,用無菌的手術(shù)剪將植物根、 莖、 葉剪成小段,根和莖沿剖面剪成1~2 mm厚的片段,葉片切成3 mm×3 mm 的方塊,置于培養(yǎng)基平板上,在28 ℃下培養(yǎng)3 d.觀察外植體周圍有無菌落形成,挑取內(nèi)生菌株菌絲到PDA培養(yǎng)基中,置于28 ℃下繼續(xù)培養(yǎng)3~5 d.反復(fù)轉(zhuǎn)接至純培養(yǎng)后,將菌株接種到斜面培養(yǎng)基上,保存至4 ℃冰箱中備用.

        空白對照:將上述經(jīng)過表面消毒后未切割的樣品置入空白平板中,28 ℃下培養(yǎng), 若材料周圍未長出雜菌,則說明所分離的菌株為內(nèi)生菌株.

        1.4 內(nèi)生菌株的形態(tài)學(xué)鑒定

        觀察內(nèi)生菌菌落形態(tài)特征.挑取分離得到的純培養(yǎng)物,用乳酸石炭酸棉藍(lán)染色,常規(guī)鏡檢,觀察內(nèi)生菌株的顯微形態(tài).參照《真菌鑒定手冊》,對分離的內(nèi)生菌株進(jìn)行分類、鑒定[7-10].

        1.5 抗氧化活性篩選

        1.5.1 內(nèi)生菌株發(fā)酵液清除DPPH自由基能力的測定

        從PDA培養(yǎng)基上取活化的真菌適量,分別接種到100 mL錐形瓶內(nèi)50 mL液體培養(yǎng)基中,于28 ℃搖床中120 r/min 振蕩培養(yǎng)7 d.發(fā)酵液經(jīng)紗布過濾后,用乙酸乙酯等體積萃取3次,濃縮至干,4 ℃保存.分別精密稱取干燥恒重的各乙酸乙酯提取物5 mg,甲醇溶解并稀釋至50 mL,即100 μg/mL備用.

        1) 準(zhǔn)確稱取1.971 5 mg DPPH,用甲醇溶解,定容至25 mL容量瓶.

        2) 分別移取各樣液0.5 mL于10 mL具塞試管中,加入0.5 mL DPPH-甲醇溶液,充分混勻,室溫靜置30 min后,測定A517(Ai)(以甲醇作參比).

        3) 0.5 mL DPPH-甲醇溶液與0.5 mL甲醇溶液混合后測定A517(Ac).

        4) 0.5 mL樣液與0.5 mL甲醇溶液混合后測定A517(Aj).

        抗氧化能力用抑制率來表示[11],即

        1.5.2 總抗氧化能力的測定(FRAP值測定)

        取各真菌發(fā)酵液,適當(dāng)稀釋后移液器取100 μL,加入FRAP工作液3 mL,混勻反應(yīng)20 min,于593 nm處讀取吸光度.以FeSO4為標(biāo)準(zhǔn)物繪制標(biāo)準(zhǔn)曲錢,求得回歸方程.樣品的抗氧化能力以FRAP值表示:1FRAP單位=1 μmol FeSO4,即樣品的抗氧化能力相當(dāng)于FeSO4的μmol/L數(shù)[12].

        1.6 活性菌株的分子生物學(xué)鑒定

        1.6.1 基因組提取

        采用SK1375真菌基因組抽提試劑盒提取菌株基因組.

        參照酵母26S rDNA D1/D2區(qū)引物NL1:5’-GCA TAT CAA TAA GCG GAG GAA AAG-3’和NL2:5’- GGT CCG TGT TTC AAG ACG G-3’[13]引物對,由上海生工公司合成.25 μL擴(kuò)增體系包括:Template(基因組)10 pmol,Primer up (10 μM) 0.5 μL,Primer down (10 μM) 0.5 μL,dNTP mix (10 Mm each) 0.5 μL,10×Taq reaction Buffer 2.5 μL,Taq (5 U/μL) 0.2 μL,加水至25 μL.PCR反應(yīng)擴(kuò)增儀進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增程序?yàn)椋侯A(yù)變性94 ℃ 5 min;循環(huán)94 ℃ 30 s,55 ℃ 35 s,72 ℃ 60 s,35個(gè)循環(huán),循環(huán)結(jié)束后72 ℃下延伸8 min.擴(kuò)增完成后,將產(chǎn)物送往上海生工生物公司測序.

        1.6.2 序列比較及發(fā)育樹構(gòu)建

        以Colletotrichum屬26S rDNA D1/D2序列為參照,對PCR產(chǎn)物測序結(jié)果在Genbank數(shù)據(jù)庫內(nèi)進(jìn)行同源序列搜索(blast search),找出該菌株與數(shù)據(jù)庫中同源性最高的模式菌株,用MEGA 5.1進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析和進(jìn)化樹構(gòu)建.

        2 結(jié)果分析與討論

        2.1 甘草內(nèi)生真菌的分離與鑒定

        如表1所示,從甘草植株的根、莖、葉中共分離得到14株內(nèi)生真菌,其中從根中分離得到6株,從葉、莖中均分離得到4株.甘草的不同組織中,內(nèi)生菌株的種類也不同.從根中分離到的內(nèi)生菌株歸屬于3個(gè)屬,依次為鐮孢霉屬、炭疽菌屬、毛霉屬,其中毛霉屬最多.從莖中分離得到青霉屬與炭疽菌屬內(nèi)生菌株.從葉中只分離到青霉屬. 從所分離菌株的種屬來看,其中青霉屬數(shù)量最多,為優(yōu)勢菌屬.

        表1 甘草組織中內(nèi)生菌株的分布

        2.2 清除DPPH自由基能力的測定

        對14株內(nèi)生真菌發(fā)酵液進(jìn)行清除DPPH自由基活性的測定,結(jié)果見圖1.由圖1可知:所分離獲得的菌株普遍表現(xiàn)出較強(qiáng)的抗氧化活性.其中有4株真菌清除DPPH能力最強(qiáng),清除率高達(dá)95%以上,分別為菌株L1-1,L2-1,R2-1,S2-1,最弱的為菌株R1-1,清除率為54%.

        圖1 14株內(nèi)生真菌對DPPH自由基的清除率

        2.3 FRAP法篩選

        以標(biāo)準(zhǔn)品(FeSO4)溶液的吸光度值y與標(biāo)準(zhǔn)品(FeSO4)濃度x(mmol/L)進(jìn)行線性回歸,求得線性回歸方程y=0.286 9x+0.064 3,R2=0.998 4.結(jié)果表明FeSO4濃度在0~1 mmol/L范圍內(nèi)與吸光度呈良好的線性關(guān)系.取各真菌發(fā)酵液,適當(dāng)稀釋后移液器取100 μL,加入FRAP工作液3 mL,混勻反應(yīng)20 min,于593 nm處讀取吸光度,對照標(biāo)準(zhǔn)曲線,求得FRAP值見表2.

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:總抗氧化最強(qiáng)的為S2-2;清除DPPH能力最強(qiáng)的為S2-1;綜合比較總抗氧化活性和清除DPPH能力,R2-3和L1-2 2株菌株比較突出.綜合分析DPPH法和FRAP法,中藥甘草中普遍存在具有抗氧化活性的內(nèi)生真菌,其中根中具有強(qiáng)氧化活性的菌株占33%,莖中占50%,葉中占25%.酵母屬的菌株S2-2和R2-3具有高抗氧化能力,強(qiáng)于毛霉屬菌株.甘草中不同部位分離得到的內(nèi)生真菌抗氧化能力不同,不同種屬的菌株其抗氧化活性也存在一定差異.

        表2 14種內(nèi)生真菌的FRAP值1)

        2.4 活性菌株分子生物學(xué)鑒定

        由圖1和表2可知:內(nèi)生真菌菌株R2-3對DPPH自由基的抑制率達(dá)91.78%,F(xiàn)RAP值為298,較空白組有極顯著提高.菌株R2-3為本實(shí)驗(yàn)抗氧化活性測定最為顯著的菌株,對其進(jìn)行進(jìn)一步的分子生物學(xué)鑒定.利用26S rDNA D1/D2區(qū)引物對其進(jìn)行擴(kuò)增,得到一條約606 bp的條帶,結(jié)果見圖2.

        M—標(biāo)準(zhǔn)DNA分子量;1—R2-3

        取PCR產(chǎn)物40 μL,由上海生工生物工程公司完成測序工作,測序結(jié)果如下:

        GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAA

        CCAACAGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTG

        AAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGG

        CCCCCCGGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGG

        ATGCTTTTGGCGCGGTGCCTTCCGAGTTCCC

        TGGAACGGGACGCCATAGAGGGTGAGAGCC

        CCGTACGGTTGGACACCAAGCCTGTGTAAA

        GCTCCTTCGACGAGTCGAGTAGTTTGGGAA

        TGCTGCTCAAAATGGGAGGTATATTTCTTC

        TAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAG

        CGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAA

        AGCACTTTGAAAAGAGGGTTAAACAGCAC

        GTGAAATTGTTAAAAGGGAAGCGCTTGTG

        ACCAGACTTGCGCCCGGTGAATCACCCAGC

        TCTCGCGGCTGGGGCACTTTGCCGGCTCAG

        GCCAGCATCAGCTCGCCGTCGGGGACAAAA

        GCTTCGGGAACGTAGCTCTCTTCGGGGAGT

        GTTATAGCCCGCTGCACAATACCCTTCGGC

        GGGCTGAGGTACGCGCTCCGCAAGGATGCT

        GGCGTAATGGTCATCAGCGACCCGTCTTGA

        AACACGGAC

        PCR產(chǎn)物測序結(jié)果在NCBI上進(jìn)行BLAST比對,應(yīng)用相關(guān)軟件將菌株R2-3與同源性較近的代表菌株26S rDNA序列進(jìn)行多重比較后構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖3.比對分析發(fā)現(xiàn):菌株R2-3擴(kuò)增片段的堿基序列與Colletotrichumgloeosporioides的26S rDNA序列同源性高達(dá)100%,由此證明所篩選到的抗氧化活性菌株為炭疽菌.

        圖3 R2-3菌株與其他菌株親緣關(guān)系的發(fā)育樹

        3 結(jié) 論

        實(shí)驗(yàn)采用了兩種方法評(píng)估了14株甘草內(nèi)生菌株發(fā)酵液的抗氧化活性.DPPH法篩選出的4株內(nèi)生菌株L1-1,L2-1,R2-1,S2-1對DPPH自由基的清除率達(dá)95%以上;FRAP法檢測3株內(nèi)生菌株L1-2,S2-2,R2-3表現(xiàn)較高的還原力,F(xiàn)RAP值分別為256,309,298,占菌株總數(shù)的14.3%,其他內(nèi)生菌株也在不同程度上表現(xiàn)出一定的抗氧化活性.結(jié)果表明:甘草內(nèi)生真菌是篩選天然抗氧化活性成分或先導(dǎo)化合物的潛在資源.本次實(shí)驗(yàn)首次從烏拉爾甘草中分離到炭疽病菌,且其具有較高的抗氧化活性.炭疽菌雖為致病菌,會(huì)侵染植物造成病害,同時(shí)宿主甘草中亦存在抑菌活性物質(zhì)[14],但兩者能在特殊的生境中形成良好的共生關(guān)系,其共生機(jī)制還有待深入研究.

        參考文獻(xiàn):

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